近年来,空间技术可谓是科研界的新宠,而10x Genomcs的空间转录组技术也是走在科研的前列。通过空间组学技术,可以弥补单细胞测序没有空间位置信息的缺憾,在组织原位检测细胞的基因表达及相互作用,深入探索组织微环境的变化与生长发育以及病变的关系。就在最近,国内首篇植物10x Visium空间转录组文章也已经上线了!复旦大学戚...
1.兰花器官早期发育的空间转录组测序和细胞类型识别 兰科具有高度的生物多样性,是被子植物中最大的科之一,拥有763个属、28000多个种。这些物种约占被子植物物种总数的10%,具有不同的生态环境和花结构,因此兰科被作为研究花器官发育和进化的模式类群。本研究在 10x Genomics Visium 平台上对蝴蝶兰进行了空间转录组测序,...
10x Visium是基于条形码技术的空间转录组平台,可以从一个完整的组织样本中产生转录组数据,并可以追溯基因表达的位置,这项技术对于研究器官发育过程中细胞命运与位置的关系、鉴定新的细胞类群或组织提供了重要思路。随着实验技术的不断优化,10x Visium已经不局限于动物研究,多种植物组织(包括顶芽、叶片、花、茎等)已经有...
tip1:新鲜植物样本包埋后,内部的结构组织也相对比较脆弱,已经使用过的刀片可能已经存在肉眼无法看到的小伤口,会直接体现在植物组织切片的完整性上。因此,对于植物样本,在常规切片的基础上,应尽量使用新刀片,以减小对组织切片的机械损失。 tip2:由于植物组织的脆弱性,切片过厚更易造成对组织表面的损伤,导致组织切面上...
组织染色方法有多种,苏木精-伊红(HE)染色是动物组织形态学和病例组织学中最常用的染色方法。在空间转录组研究中,动物组织切片也是用HE染色。但HE染色在很多植物样本中染色效果并不好,因此,植物样本更倾向于选用甲苯胺蓝染色。下面小欧为大家介绍空间转录组平台上经常用到的这两种染色方法。
近年来,空间技术可谓是科研界的新宠,而10x Genomcs的空间转录组技术也是走在科研的前列。通过空间组学技术,可以弥补单细胞测序没有空间位置信息的缺憾,在组织原位检测细胞的基因表达及相互作用,深入探索组织微环境的变化与生长发育以及病变的关系。就在最近,国内首篇植物10x Visium空间转录组文章也已经上线了!复旦大学戚...
近年来,空间技术可谓是科研界的新宠,而10x Genomcs的空间转录组技术也是走在科研的前列。通过空间组学技术,可以弥补单细胞测序没有空间位置信息的缺憾,在组织原位检测细胞的基因表达及相互作用,深入探索组织微环境的变化与生长发育以及病变的关系。就在最近,国内首篇植物10x Visium空间转录组文章也已经上线了!复旦大学戚...