近日,新疆揭榜挂帅项目“棉花品种重大农艺性状解析与分子设计育种”2024年度总结会召开,会上发布了新疆棉花分子育种项目在基因组解析、育种技术优化和新种质创制等方面取得的关键进展。 项目组系统解析了源棉8号高质量的T2T(染色体端粒到端粒)基因组,构建了包含3.2亿个碱基对的高精度遗传图谱。通过比对分析,锁定12个与抗
自朱玉贤院士团队与合作者在2012年首次公布雷蒙德氏棉基因组以来，棉花基因组学取得了一系列重要进展，推动了功能基因组学研究以及棉花复杂性状的解析 (Du et al., 2018; Huang et al., 2021; Huang et al., 2020; Wang et al., 2012)。然而，棉花基因组的准确与完整解析，尤其是复杂的转座子序列及其生物学...
2025年3月17日,《自然遗传学》期刊刊登了一项研究成果,中国农业科学院棉花研究所国家棉花生物育种重点实验室马雄风领导的研究团队成功完成了棉花品种“中棉113”的端粒到端粒全基因组组装,极大提升了棉花基因组组装的精度。棉花作为全球重要的经济作物,其复杂的多倍体基因组结构一直以来都是研究的难点。此次研究团队创新性...
自朱玉贤院士团队与合作者在2012年首次公布雷蒙德氏棉基因组以来,棉花基因组学取得了一系列重要进展,推动了功能基因组学研究以及棉花复杂性状的解析 (Du et al., 2018; Huang et al., 2021; Huang et al., 2020; Wang et al., 2012)。然而,棉花基因组的准确与完整解析,尤其是复杂的转座子序列及其生物学功...
此次研究团队创新性地融合了PacBio HiFi、牛津纳米孔超长读长测序以及Hi-C等先进技术,以前所未有的精度解析了棉花基因组,不仅完整地呈现了26个着丝粒区域和52个端粒区域,还精确定位了5S rDNA簇和核仁组织区,极大地提升了棉花基因组的完整性和连续性。 “中棉113”是一款特早熟、高衣分、优质高产的棉花品种,尤其在...
Nature Genetics | 朱玉贤院士团队发布首个棉花基因组完整图谱,阐述棉族独特折叠胚胎形成的分子与演化机制 植物种子及其周围结构提供的营养维持了人类文明的延续与发展。植物种子胚胎是营养的储存器,展现出丰富的结构多样性,反映了植物在进化过程中对环境适应的独特策略。1946年,早期植物学家A. C. Martin根据种子胚胎大小...
测序策略：PacBio sequel Ⅱ+ Illumina NovaSeq + Hi-C + RNA-seq技术路线图研究结果1、构建一个更完整的棉花参考基因组由于TM-1 v2版本的参考基因组无法准确区分棉花基因组中高度重复的外周中心区的序列，无法准确解析这些高度重复的区域，因此本文研究者利用PacBio CLR、Illumina和Hi-C测序重建了TM-1参考基因组...
美国哈德逊-阿尔法生物技术研究所对三个现代棉花品种(UGA230、UA48和CSX8308)构建了高质量的参考基因组,并更新了棉花遗传标准参考基因组“TM-1”,通过高通量测序和生物信息学分析对这些全基因组比对,揭示了4个基因型间的序列、结构和基因含量差异;随后结合差异表达分析,鉴定了一大批与纤维发育相关的差异基因,从而为...
与其他基因工程工具相比,CRISPR/Cas技术能够在棉花基因组内进行精确和高效的操作。目前,CRISPR/Cas技术包括先导编辑、碱基编辑和多重编辑,扩大了棉花育种中可靶向性状的范围。CRISPR/Cas基因组编辑已被成功用于培育具有优良农艺性状(包括产...
通过深入挖掘功能性转座子,发现由三个新分子(miR2947-DNA转座子MuTC01-加倍基因LEC2b)组成的三级小RNA调控机制,从而阐明了棉花复杂折叠胚胎形成的分子调控与演化机制 (Huang et al., 2024)。 图2 朱玉贤院士团队在棉花基因组和功能研究取得重要进展 该研究整合了最新的测序技术和算法(希望组为本研究提供了NGS、...