先做桑基图,作图数据的话是我们GO富集的结果,自己整理数据,至于每个Trems展示的基因可以选择对自己研究展示关键的基因。 df <- read.csv("df.csv", header = T)df1 <- df[,-1]colnames(df1)df1_trans <- df1 %>%make_long(gene, pathway)df1_trans$node <- factor(df1_trans$node,levels = c(df1...
setwd("D:/KS项目/公众号文章/桑基图结合富集分析图")library(tidyverse)# devtools::install_github("davidsjoberg/ggsankey")library(ggsankey)library(ggplot2)install.packages("cols4all")library(cols4all) 先做桑基图,作图数据的话是我们GO富集的结果,自己整理数据,至于每个Trems展示的基因可以选择对自己研...
Tableau 2024.2版本中正式推出 Viz Extentions 可视化扩展,并同步发布了官方及合作伙伴开发的24个高级可视化,分别是: 关联月度:Tableau创建桑基图、径向图等复杂可视化T… 桑基气泡图 – 5个维度展示KEGG通路富集结果 微生信 0代码在线绘制200+款科研图,助力做ppt,发文章 ...
先做桑基图,作图数据的话是我们GO富集的结果,自己整理数据,至于每个Trems展示的基因可以选择对自己研究展示关键的基因。 df <- read.csv("df.csv", header = T)df1 <- df[,-1]colnames(df1)df1_trans <- df1 %>%make_long(gene, pathway)df1_trans$node <- factor(df1_trans$node,levels = c(df1...
前不久在微信VIP群有小伙伴发了一张图,是关于富集分析的,只不过展示和我们之前的不太一样,是桑基图+气泡图的形式,特点就是GO terms和其对应的关键基因用桑基图展示,GO结果用气泡图展示。这幅图在很多在线生信工具中都有,很方便就能完成。本来是不想做了,但是很巧,又在别的文献中看到了,所以做一下,还是比较...
前不久在微信VIP群有小伙伴发了一张图,是关于富集分析的,只不过展示和我们之前的不太一样,是桑基图+气泡图的形式,特点就是GO terms和其对应的关键基因用桑基图展示,GO结果用气泡图展示。这幅图在很多在线生信工具中都有,很方便就能完成。本来是不想做了,但是很巧,又在别的文献中看到了,所以做一下,还是比较...