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根据gtf文件提取基因组中exon+intron+intergenetic等不同区域
根据gtf文件提取基因组中exon+intron+intergenetic等不同区域
2024-12-20 19:10:13
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含义
根据GTF文件,提取基因组中Exon、Intron、Intergenetic等不同区域
目标: 根据下载的GTF文件,利用bedtools提取基因组的不同区域。 实例: 见参考的网站 参考: 1、https://davetang.org/muse/2013/01...
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根据gtf文件提取基因组中exon intron intergenetic等不同区域
从gtf或gff中提取exon、gene等区域的bed文件
在cellranger制备参考基因组前 把gtf文件里的线粒体基因添加“mt-”前缀
基于gff3/gtf文件 提取所有基因的最长代表转录本序列
egfr基因 exon-19外显子19-del基因突变
基因组序列文件 id 和 gff3/gtf 文件的染色体id不一致
基因组注释文件 gff gtf 下载
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