多重PCR反应是指在单次PCR反应中同时扩增一种以上的靶基因。现有多种荧光染料可使用,使得运行多重实时荧光PCR成为可能。如能同时检测新冠、甲流、乙流的核酸检测试剂盒,实验原理就是多重PCR。常见的荧光探针,例如Taqman探针、分子信标、蝎型探针和LUX荧光引物都可用于多重PCR实验,只要每条探针标记具有不同光谱的染料。