选择ncbi中的blast进去,然后进行分析 蛋白质和蛋白质之间的比对是blastp,这里红色的框都是需要选择的,organism组织选择是 拟南芥植物,比对的数据库蛋白质nr数据库, 同源序列的查找,总共找到了41个同源蛋白,参考物种是拟南芥植物:Arabidopsis thaliana (taxid:3702),后面的query score代表的是相似度是多少 发生的时间是...
1 首先登陆https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed，NCBI首页。点击首页下端BLAST,进入blast界面。2 BLAST界面提供blastn，blastp，blastx，tblastn，tblastx等选项。已知蛋白序列，查找某菌种对应的同源基因信息，点击tblastn 3 点击进入后，复制蛋白序列到序列框，或者“选择文件”。选择Organism。完成上述信息后，点击b...
1.找到目的蛋白质序列和所在家族中不同subfamily的代表蛋白的序列 因为现在只比较人类基因组中的情况。所以只要在人类基因组数据库中搜索Arl8b就能找到了。 https://www.genenames.org 以fasta的格式拷贝到txt文档中,用同样的流程把同家族的subfamily的代表蛋白序列下载好。 将txt格式变为fas格式(只需将文件名的.txt...
把你的序列copy到最上面那个框框，点下面蓝色BLAST按钮就好了。另外还有很多参数可以调，慢慢钻研吧。
到NCBI官网，数据库选择protein，输入蛋白质名称，然后再结果里找物种为human的结果，拿到这个序列到NCBI的Blast里比对，程序选择Blastp，比对结果中肯定至少有一个是小鼠同源蛋白。或者直接用clustalX把human，mice的蛋白序列直接比较。
你可以去网上找PDB数据库.或者是SWISS-PROT库、PIR库,PDB库是一个蛋白质一级结构数据库...或者去GenBank数据库看看,不过这个好像是以核酸为主的.
GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN 鼠胰岛素的一级结构序列如下;MALWMRFLPLLALLFLWESHPTQAFVKQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPMSRREVEDPQVAQLELGG GPGAGDLQTLALEVAQQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN 比较如下;放大以及加下划线的是人与小鼠相同的一级结构序列。不同的一级结构序列是字体比较小的那部分。从...