为了更好的获取单细胞染色质可及性信息,瞿昆教授课题组开发了ftATAC-seq测序技术。该技术是一种基于流式分选,并利用荧光标记转座酶插入细胞染色质的单细胞染色质可及性测序方法。相比于现有的同类技术,ftATAC-seq结合了细胞蛋白组信息,可以富集表达特异表面分子的细胞群体,同时利用荧光染料标记转座酶的插入量,因而可以...
基于单个细胞或细胞核的RNA测序可以揭示细胞的转录状态,而染色质可及性测序(ATAC-seq)则可以对细胞内转录因子的结合位点和染色质调控区域进行分析,帮助探索DNA转录的上游调控机制。但当前的单细胞测序技术,基本上都是在不同细胞中分开进行RNA测序或是染色质可及性测序,并通过统计学方法进行计算整合,进而实现对以上组学...
导读:近日,发表在《Cell》上的研究表明,加州大学圣地亚哥分校、Ludwig癌症研究所——任兵(音译)博士等研究人员绘制了人类基因组的单细胞染色质可及性图谱。他们使用单细胞ATAC-seq测序技术对来自30种成人组织类型的60多万个人类细胞进行了剖析,然后将这些信息与15种胎儿组织类型的类似数据相结合,以揭示130万个细胞核组成...
近日,相关论文以《ISSAAC-seq 可对单细胞中的染色质可及性和基因表达进行灵敏灵活的多模式分析》(ISSAAC-seq enables sensitive and flexible multimodal profiling of chromatin accessibility and gene expression in single cells)为题发表在 Nature Methods 上 [1]。 图| 相关论文(来源:Nature Methods) 徐炜、杨伟龙...
基于单个细胞或细胞核的RNA测序可以揭示细胞的转录状态,而染色质可及性测序(ATAC-seq)则可以对细胞内转录因子的结合位点和染色质调控区域进行分析,帮助探索DNA转录的上游调控机制。但当前的单细胞测序技术,基本上都是在不同细胞中分开进行RNA测序或是染色质可及性测序,并通过统计学方法进行计算整合,进而实现对以上组学...
基于此,非常有必要研发出一款更简洁、更灵敏、更能广泛应用的单细胞多组学技术。而靳文菲及其合作课题组研发的 ISSAAC-seq,完全具备上述优点。 近日,相关论文以《ISSAAC-seq 可对单细胞中的染色质可及性和基因表达进行灵敏灵活的多模式分析》(ISSAAC-seq enables sensitive and flexible multimodal profiling of chromati...
近日,发表在《Cell》上的研究表明,加州大学圣地亚哥分校、Ludwig癌症研究所——任兵(音译)博士等研究人员绘制了人类基因组的单细胞染色质可及性图谱。他们使用单细胞ATAC-seq测序技术对来自30种成人组织类型的60多万个人类细胞进行了剖析,然后将这些信息与15种胎儿组织类型的类似数据相结合,以揭示130万个细胞核组成的222...
导读:近日,发表在《Cell》上的研究表明,加州大学圣地亚哥分校、Ludwig癌症研究所——任兵(音译)博士等研究人员绘制了人类基因组的单细胞染色质可及性图谱。他们使用单细胞ATAC-seq测序技术对来自30种成人组织类型的60多万个人类细胞进行了剖...