1染色质免疫共沉淀 染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)是一种使用测序技术来研究染色质蛋白结合DNA及与基因表达的调控的新兴基因组学技术。它是染色质免疫沉淀(ChIP)技术与高通量测序技术的结合。通过染色质免疫共沉淀测序技术,可以确定细胞中的基因组上的结合位点,研究特定的蛋白质和DNA,及基因转录的调控机制,以及...
简言之,这种方法的思想就是:把每次免疫沉淀获得的靶信号表述为占总Input样品染色质(总Input样品染色质的意思就是这次实验每个样本超声或酶切后得到的总染色质)的百分比。 具体计算方法如下: 从ChIP获得的anti-target组和IgG组信号除以总Input样品染色质。通常1%的起始染色质用作Input,即实验中Input管取的是原始样本...
染色质免疫共沉淀技术(ChIP) 染色质免疫共沉淀可应用于: (1)组蛋白修饰酶的抗体作为“生物标记”;(2)转录调控分析; (3)药物开发研究; (4)DNA损失与凋亡分析。 ◆◆ 实验原理◆◆在保持组蛋白和DNA联合的同… 冉盛网 染色质免疫沉淀(ChIP)实验 如期生物 免疫组化染色过程中遇到问题集合 一、简介良好的免疫...
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。运...
总的来说,ChIP-seq技术是一种非常有用的高通量测序技术,可以帮助我们了解基因组中蛋白质与DNA相互作用的信息,从而深入研究基因表达、转录调控、染色质结构和功能等方面的问题。随着技术的不断发展和完善,相信ChIP-seq技术将在生命科学研究中发挥越来越重要的作用。©...
染色质免疫共沉淀测序通过超声或酶处理将染色质随机切割,利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来,再通过反交联释放结合蛋白的DNA片段,最后对目的DNA片断进行纯化与文库构建,通过高通量测序的方法获得蛋白质与DNA相互作用的信息。染色质免疫共沉淀测序技术路线...
染色质免疫共沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP):通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。 技术流程 点击查看大图 技术参数 测序平台与方式:HiSeq,...
该研究开发了一种新型染色质免疫共沉淀测序技术——aChIP技术,可普遍适用于植物经济器官。研究以油菜为例,首次解析了作物种子休眠和萌发过程中组蛋白修饰景观的动态变化及其潜在功能。 染色质免疫共沉淀测序技术(ChIP-seq)被认为是鉴定全基因组组蛋白修饰和染色质相关蛋白结合位点的金标准。由于作物经济器官通常具有坚硬...
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipition, ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法,与第二代测序技术相结合,ChIP Sequencing(ChIP-seq)可以在全基因组范围内对蛋白的结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,广泛应用于组蛋白修饰,特定转录因子的基因调控作用研究等相关领域,为差异化表观遗传变异的原理揭示...
据2014年9月10日《科 学网》援引报道,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊课题组与汤富酬课题组合作,发展了一种基于微流控芯片的微量细胞样品处理与核酸俘获方法,并成功实现 了针对1000个细胞的染色质免疫沉淀测序(Ch IP-Seq).研究结果在线发表在《细胞研究》上.应用Ch IP-Seq方法,通过有针对性地俘获和富集特定...