染色质免疫共沉淀(ChIP)实验技术是一项在生物医学研究中广泛应用的方法,通过揭示蛋白质与DNA之间的相互作用,为深入理解基因表达调控机制、疾病发生及表观遗传机制提供了关键信息。随着高通量测序技术的发展,ChIP实验的应用范围将进一步扩展,为基因调控研究及相关领域提供更多的科学见解。科研人员应掌握ChIP实验的原理和操作...
近年来发展起来的ChIP-chip技术将基因组DNA芯片(chip)技术与染色质免疫沉淀技术(ChIP)相结合,为研究目的蛋白与整个基因组相互作用提供了可能。ChIP-chip 技术通过标记染色质免疫沉淀富集的DNA片段,和另一个被标记不同探针的对照组样品一起,与DNA芯片杂交,再利用各种生物信息学方法对收集到的信号进行分析,具体的实验步...
染色质免疫沉淀所选择的目的蛋白的抗体是ChIP实验成功的关键。因为在蛋白质与染色质交联结合时,抗体的抗原表位可能因为与结合位点的距离太近,不能被抗体识别,所以不能有效地在体内形成免疫沉淀复合物,直接影响ChIP的结果。所以不是所有的抗体都能做ChIP实验的,只有经过ChIP实验验证后的抗体才能确保实验结果的可靠性,比如...
染色质免疫共沉淀技术的原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。 今天,我们将重点介绍免疫(共)沉淀实验。免疫沉淀(IP)与免疫共沉...
染色质免疫沉淀 (ChIP) 技术方法是一种用于在细胞天然染色质背景下探测蛋白质-DNA 相互作用的强大技术。这种方法可以用于检测特定转录因子与基因组某个启动子元件的结合水平,也可以用于检测整个基因组范围内位点上某种特定组蛋白修饰水平。染色质免疫沉淀是理解染色体的一种革命性工具,使研究者可以了解染色质及其相结合的...
染色质免疫沉淀芯片(Chip-Chip) 该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点,ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途(1)在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。(2)染色体活性状态的...
染色质免疫共沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP):通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。
染色质免疫共沉淀技术(ChIP)基于体内分析而发展的染色质免疫沉淀分析(Chromatin immunoprecipitation assay kit,ChIP)技术可以真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白。由于ChIP采用甲醛固定活细胞或者组织的方法,因此能比较真实的反映细胞内TF与Promoter的结合情况,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系...
染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)简介和发展趋势 ChIP-seq实验原理和课题设计思路 ChIP-seq的主要应用方向:组蛋白修饰和转录因子 ChIP-seq数据分析和注意事项 直播讲师: 张杜 中南大学博士、中国农业科学院农业基因组研究所博士后、表观基因组学研究方向。 长期从事转录组学及表观遗传学领域,参与多项 DNA 甲基化及转录组...
本节课您将学习到: 染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)简介和发展趋势 ChIP-seq实验原理和课题设计思路 ChIP-seq的主要应用方向:组蛋白修饰和转录因子 ChIP-seq数据分析和注意事项