将小鼠饲养在病原体的环境中,12小时光照/黑暗循环,温度保持22-24°C,相对湿度40–70%,吸入二氧化碳进行安乐死,提取样本对体细胞重编程,进行RNA-seq、ATAC-seq和ChIP-seq等测序分析。 结论 作者通过对小鼠体细胞重编程过程中进行转录组和ChIP-seq等测序分析,揭示了H3K27me3去甲基化酶JMJD3与KLF4在体细胞重编程...
去除染色质交联之后,使用典型的酚-氯仿及随后的乙醇沉淀方法或使用 DNA纯化柱试剂盒来进行DNA纯化。一旦完成了 DNA 纯化,便可进行多种下游分析,包括ChIP-qPCR、ChIP-芯片和ChIP-seq。 三、ChIP实验重点实验细节 1、交联 内源状态下,蛋白和DNA的结合多数是动态的,交联能实现捕获特定时间内蛋白和DNA结合的情况。交联...
它通过多种蛋白质组学和分子生物学方法,包括交联、细胞裂解(蛋白质-DNA提取)、核酸剪切、抗体免疫沉淀、DNA样本回收,将蛋白-DNA复合物分离出来进一步研究特定的结合蛋白或与其结合的DNA,同时结合qPCR(ChIP-qPCR)可用于检测已知蛋白与特定结合位点的DNA是否结合以及结合的强度,结合二代测序(ChIP-seq)可用于分析目标...
将测序结果与参考基因组比对,比对上唯一位置的序列用于后续标准信息分析及个性化分析。信息分析流程如下: 此节内容为Chip-seq基本流程介绍,包括 实验流程 建库流程 分析流程 2. 数据结果及生物信息分析 2.1. ChIP Sequencing 文库质检结果 文库片段质检,ChIP文库的染色质片段在100-500bp之间,建库加入约140bp的接头后,...
染色质免疫共沉淀(CHIP),染色质免疫共沉淀染色质免疫共沉淀技术(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与新一代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全
⑤qPCR分析:通过设计特异性引物,对目标DNA序列进行qPCR分析,定量检测目标序列的富集情况。 三、ChIP实验的技术结合 随着高通量测序技术的发展,ChIP实验的应用范围得到了极大的扩展。其中,ChIP-seq技术结合了ChIP与高通量测序,能够在全基因组范围内揭示蛋白质与DNA的相互作用。ChIP-seq技术通过富集特定蛋白结合的DNA片段,...
ChIP seq Western blot检测样本(input)中的诱饵蛋白 Western blot检测图 4-5周 实验样本 诱饵蛋白的IP级抗体 实验信息表 点击询价 ChIP调取诱饵蛋白及其结合的DNA片段 (2组:实验组和对照组) 诱饵蛋白的Western blot检测图 ChIP实验报告 Seq检测ChIP产物中的DNA片段并分析 (2组:input组和实验组) Seq检测结果 检...
图1 Cut&Tag实验流程图 2. Cut&Tag优势 为证明Cut&Tag技术的有效性,作者在对组蛋白H3K27me3进行研究时对比使用了ChIP-seq、Cut&RUN、Cut&Tag三种方法。从不同角度对三组数据进行比较后,发现Cut&Tag技术具有显著优势,具体结果如下: (1)背景噪音低 ...
染色质免疫共沉淀测序ChIP-Seq结题报告.PDF,染色质免疫共沉淀测序 ChIP-Seq结题报告 深圳市艾斯基因科技有限公司 2017 年 3 月 1 日 目录 1工作流程1 1.1 ChIP 免疫沉淀实验流程 1 1.2 ChIP Sequencing 文库构建流程2 1.3 生物信息分析流程 2 2生物信息分析4 2.1 数据处理与