通过30×的HiFi、90×的Hi-C、45×的Illumina、36×的10x等多种测序,研究者组装构建了两套单倍型大小分别为21.73Gb(HA)、21.75Gb(HB)的赤松基因组,并将赤松基因组挂载到12条染色体上;通过注释,分别在HA和HB中注释得到44233和44215个蛋白编码基因。 将赤松单倍型基因组与其它松属基因组(P. tabuliformis、P. ...
论文第一作者、亚林所博士研究生丁显印说，他们首次针对我国湿地松基础育种群体开展了主要经济性状的大规模转录组测序，成功组装了群体中240株代表性单株的基因组Unigenes，开发了53229个高质量单核苷酸多态性(SNPs)分子标记，并首次基于群体遗传结构进行了全基因组关联研究（GWAS）、全转录组关联研究（TWAS）和加权基因...
图4 湿地松形态性状共变异的主成分分析。每个点代表一个单独的树,根据cos2值进行颜色编码,这表明树在PCA图中的表示质量。每个箭头表示各自形态特征与主成分之间的相关方向和强度。 图5 湿地松形态性状相关热图。相关系数值的颜色强度和符号范围从- 1到+1,其中蓝色阴影表示正相关,红色阴影表示负相关。相关值为1表示...
论文第一作者、亚林所博士研究生丁显印说,他们首次针对我国湿地松基础育种群体开展了主要经济性状的大规模转录组测序,成功组装了群体中240株代表性单株的基因组Unigenes,开发了53229个高质量单核苷酸多态性(SNPs)分子标记,并首次基于群体遗传结构进行了全基因组关联研究(GWAS)、全转录组关联研究(TWAS)和加权基因共表达...
作为我国特有的乡土针叶树种,油松的生态适生区达300万平方公里,因此也被称为“中国松”。长期以来,油松的基因密码一直是未解之谜。 北京林业大学针叶树遗传育种团队联合瑞典农业大学、美国密歇根理工大学等6个国家11家单位的科研人员,共同揭示了油松演化关键特征的遗传基础,为深入理解针叶树演化机制提供了重要参考。12月...
该火炬松基因组项目是由加州大学戴维斯分校小组带领,基因组拼装工作是由约翰霍普金斯大学和马里兰大学带领。其他合作机构包括印第安大学、德克萨斯农工大学、奥兰克儿童医院研究所和华盛顿州立大学。(生物通:王英) 生物通推荐原文: Aleksey Zimin, Kristian A. Stevens, Marc W. Crepeau, Ann Holtz-Morris et al. Seque...
进一步分析发现,马尾松毛虫和欧洲重要针叶林食叶害虫松异舟蛾同样有细胞色素P450基因的扩张现象,表明马尾松毛虫P450基因,尤其是CYP3家族基因可能与松针抗性化合物的耐受性有关
近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱,为油松独特适应性和发育研究、生殖生物...
解析 C 选项中各物种的基因组大小分别为: A. 水稻:约400-500百万碱基对(Mb) B. 火炬松:松科植物,基因组较大,约20-30吉碱基对(Gb) C. 拟南芥:模式植物,基因组最小,约125-135百万碱基对(Mb) D. 人:约3.2吉碱基对(Gb)。 显然,拟南芥基因组最小,故选C。
华南五针松成熟针叶基因组DNA的提取方法