研究团队采用PacBio HiFi测序、Illumina测序以及Hi-C测序技术进行从头组装，最终获得了一个高质量的杨树基因组，该基因组从端粒到端粒（T2T）的连续性得到了显著提升。该研究不仅揭示了杨树端粒和着丝粒序列的精确组成与分布，还为杨树基因组的多领域研究提供了极为宝贵的资源。这是首次对杨树所有19条染色体的高分辨率着丝粒区
研究对中国本土杨树青杨基因组进行了组装,并进行天然群体重测序,解析了青杨的群体结构及环境适应性的遗传基础。 该研究利用三代PacBio CLR、二代Illumina和Hi-C测序技术组装了青杨高质量染色体级别的基因组,基因组大小为406.55Mb,Scaffold N50为20.86Mb,99.84%的序列定位到19条染色体,共注释出35977个蛋白编码基因。
杨树基因组计划及其分子生物学研究进展 一、研究目标设定 1.核心目标 五年内完成三个主要杨树品种的高精度基因组测序，构建全球最完整的杨树基因组数据库。建立性状-基因-调控网络关联模型，解析木材形成、抗逆性、速生机制等关键性状的分子基础，为分子设计育种提供理论支撑。2.具体指标 （1）基因组测序：contigN50≥...
研究对中国本土杨树青杨基因组进行了组装,并进行天然群体重测序,解析了青杨的群体结构及环境适应性的遗传基础。 该研究利用三代PacBio CLR、二代Illumina和Hi-C测序技术组装了青杨高质量染色体级别的基因组,基因组大小为406.55Mb,Scaffold...
【详解】图示中克隆的重金属转运蛋白(HMA3)基因与外源高效启动子连接,导入杨树基因组中,若要检测获得的转基因杨树苗中是否含有导入的HMA3基因和高效启动子,需要检测是否含有高效启动子序列和HMA3基因序列,应选择的引物组合是①+②,即B正确,ACD错误。故选B。
【题目】 为了对重金属污染的土壤进行生物修复,研究者将从杨树中克隆的重金属转运蛋白(HMA3)基因与外源高效启动子连接,导入杨树基因组中(如图)。1 ③左边界右边界柯内 A内DNA t启动子 HMA3基因一终止子②(注:①、②、③、 ④表示引物)为检测获得的转基因杨树苗中是否含有导入的IM A3基因,同时避免内源HA A3...
《基于重测序的杨树基因组重组事件的研究》一、引言基因组重测序技术的迅速发展使得我们能够对整个基因组进行深入的分析和解析。杨树作为一种重要的林木资源,其基因组重组事件的研究对于理解其遗传多样性、进化历程以及育种改良具有重要意义。本文旨在通过重测序技术对杨树基因组重组事件进行研究,为进一步探讨其遗传规律和...
ASE建模 研究团队采用了XGBoost建模技术，对46个遗传和表观遗传特征进行了建模与验证，揭示DNA甲基化和基因序列差异对ASE的重要影响。模型结果显示，DNA甲基化是最关键的预测特征，模型显示出良好的预测性能和稳定性。这些分析为揭示杂种优势的遗传机制提供了全新视角，同时也为杨树基因组学研究提供了坚实的基础与工具。
杨树具有快速生长和高生产力的特点,被广泛用于木材、纸浆和生物能源的生产中。为了更好地了解杨树的生物学特性和提高其经济价值,进行杨树基因组研究至关重要。 HDZIP(Homeodomain-Leucine Zipper)基因家族是一类在植物发育和逆境响应中起重要作用的转录因子家族。HDZIP基因家族在许多植物中都存在,并参与了植物的发育和...
20.为了对重金属污染的土壤进行生物修复,研究者将从杨树中克隆的重金属转运蛋白(HMA3)基因与外源高效启动子连接,导入杨树基因组中(如图)。为检测获得的转基因杨树苗中是否含有导人的HMA3基因,同时避免内源HMA3基因的干扰,并成功获得大量的重组基因,在进行PCR扩增时,下列说法正确的是()左边界①③右边界杨树内源DNA...