Decode蛋白质pQTL数据处理完整代码(一) - 知乎 (zhihu.com) Decode蛋白质pQTL数据处理完整代码—cis&trans(二) - 知乎 (zhihu.com) 做本地的clump,需要ieugwas 包, 以及几个文件,有需要的可以关注我的微信公众号领取。回复“本地clump” http://weixin.qq.com/r/QD8OFnDExi25rTR192pS (二维码自动识别) ...
clump_kb ,clump_r2,clump_p按需设置 bfile指的是参考基因组数据,参考链接https://ctg.cncr.nl/software/magma plink_bin 指的是plink的可执行文件位置,如/usr/bin/plink,可以使用命令sudo apt install plink1.9下载1.9版本的,2.0版本的没有本地clump功能 本地clump关键代码: expo_clump<-ieugwasr::ld_clump...
11.本地数据本地clump多变量孟德尔随机化分析 4 抢首评 4 1 发布时间:2024-07-28 20:19 文云博士 粉丝2074获赞8386 热榜推荐 台媒曝大S子女监护权移交汪小菲,#S家希望汪小菲马筱梅善待孩子 #大s #汪小菲 #监护人 1.2万新闻晨报 2月11日,#王雪梅回应亚冬会被狐狸抢镜 : 快来东北抱着狐狸看比赛吧。
本地clump 本地clump的数据,自己在 dplyr::tibble列哪些数据才展现哪些数据,比在线的clump的数据要少一些。 然后出现前面:The query to MR-Base exceeded 300 seconds的问题,主要是我把很多exposure的snp放在一个txt文档里面,想一起做clump,后来觉得把exposure 逐个拆开,用for循环来逐个文件做clump。 更多学习资料 ...
03.暴露数据本地clump处理,R脚本高速快捷,告别拥挤【本地41炎症因子孟德尔随机化分析】 1207 -- 6:20 App 10. 本地数据读取孟德尔随机化【零基础药靶孟德尔随机化】 1340 -- 2:41 App 04.去除弱工具变量,筛选F值大于10的SNP【本地41炎症因子孟德尔随机化分析】 884 -- 5:23 App 案例6.告别502,vcf格式孟...
代码: ld_clump_local(temp,clump_r2=0.001,clump_kb=10000,clump_p=1,bfile='E:/GAWS_SUMSAT/1kg.v3/1kg.v3/EUR',plink_bin=get_plink_exe())
a灌木是指那些没有明显的主干、呈丛生状态的树木,一般可分为观花、观果、观枝干等几类,矮小而丛生的木本植物。常见灌木有玫瑰、杜鹃、牡丹、小檗、黄杨、沙地柏、铺地柏、连翘、迎春、月季、荆、茉莉、沙柳等。 The bush is refers to these obvious branch, has not assumed grows thickly condition trees, may...