原文链接:未知基因序列(片段)的NCBI BLAST比对搜索 欢迎关注“细猪技术”微信公众号,更早获取最新资讯 如何确定一条未知基因序列(片段)来源于哪类菌群,或许其很新奇以至于希望将其公之于众。通过基因测序和序列质控(去除嵌合体与低质量碱基)获取一条高质量基因序列(片段),则可以用于NCBI BLAST比对搜索和NCBI GenBank登录号申
首先，可能是因为你的序列与数据库中的参考基因序列完全一致，尤其是在比对到具有高度保守性的基因时。此...
大家好,这两天开始学习建树,测序的未知菌序列和下载的比对序列不在一棵树上,怎么会这样呢,不是应该未知菌和对应的已知菌序列在一起的么,我的多余的序列手动删除掉了,NJ,UP,MP,里边的方法都用了,死活不去一棵树,新手,请求各位帮忙,谢谢 1_副本.jpg 返回小木虫查看更多分享...
1我想扩增一个未知的基因,CLUSTAL X和PRIMER5.我想扩增一个未知的基因,我先在NCBI里面找到其他物种这个基因的序列,然后多重比对找到保守区,在保守区设计简并引物,扩增出保守区,再RACE PCR得到全长基因,表达蛋白.请问我的设想对吗?现在问题是:我用的CLUSTAL X多序列比对,以TXT格式导出比对结果,然后是直接把保守区...
A.通过多序列比对确定某一个未知序列是否属于某一个家族。B.通过多序列比对构建系统发生树,查看物种间或者序列间的进化关系。C.通过多序列比对查找保守片段,由此推测潜在功能区。D.通过多序列比对预测蛋白质/RNA二级结构。相关知识点: 试题来源: 解析 A,B,C,D 反馈...
未知三维结构蛋白的多重序列比对分析: 1、多重序列比对: 将需要比对的文件以FASTA格式保存在同一个文档中,建议扩展名保存为fas格式(txt也可以),最好保存在桌面(或者保存在英文目录的文件夹,不然有汉字的文件夹clustalX2.1会报错) clustalX2.1-File-Load sequence file打开文档 ...
16SrDNA序列比对同源性为99%，能确定这个未知菌是哪个种吗?我的菌的16S rDNA序列与肺炎克雷伯氏菌的...
中国生命条形码南方中心副主任王文智介绍,DNA条形码是一个特定的DNA片段序列,拥有足够的可变性以确定物种身份。 __ __ ③“简言之,DNA条形码相当于生物物种的身份证,能100%证明它是哪个物种。”王文智说,在发现一种未知物种或者物种的一部分时,研究人员会先描绘其DNA条形码,再与国际数据库内的...
本发明的一种基于序列比对的二进制未知协议报文格式划分方法,依次包括以下步骤: (1)通过对获取的网络流量进行特征提取、特征筛选和聚类等步骤,得到单一类型的协议序列集合; (2)初始化一条记录比对结果的序列,将该序列的初始值都设为零; (3)对协议序列集合中的序列两两进行局部序列比对和全局序列比对,具体过程为: ...