从本质上来说,伪时间轨迹分析是根据每个细胞的基因表达情况找出关键基因的表达模式来对细胞进行排序,反推出细胞发育轨迹,用于细胞分化的研究(胚胎发育、细胞重编程,癌细胞分化……)。 Monocle、SCUBA、STREMA、Wishbone等都可以进行单细胞轨迹分析,但Monocle因其功能强大,且是CNS主流期刊的常...
如第零节中所述,时域分析也可以对一个区间内的时间序列进行分析,其中一种方法就是做不同区间之间的对比,表现到最终结果上,还需要在上面做一层封装,轨迹聚类就是其中一种方法。 其实轨迹聚类在使用中有着巨大的局限性。首先,时间序列需要尽可能高信噪比,我们不希望存在大量的噪声,这会引入较大的误差,因此之前需要...
通过具体的实例分析，可以更深入地探讨带电粒子在不同磁场条件下的运动时间、轨迹及与其他条件的依赖关系。这些例题不仅帮助理解粒子运动的特性，同时也能指出并排除常见的误差点。例如，考虑带电粒子在由不同磁场区域组成的空间中的运动，通过分析粒子速度、磁场分布的变化，以及应用物理公式，我们可以求解粒子在磁场中运...
另外,为了了解分化过程中自噬在细胞器稳态中的作用,研究人员进一步对ATG12-/-细胞的蛋白质组进行分析,结果显示相较BNIP3L-/-细胞,ATG12-/-细胞对蛋白质组重构的影响明显更大。主要表现在(见下图):(1)ATG12-/-细胞在第12天显示...
轨迹聚类作为最终目标，选择合适的聚类方法是关键。k-means是最简单的选择，但距离定义的合理性、聚类中心选择的策略以及类别数量的确定对结果有很大影响。聚类方法的局限性在于依赖距离定义，可能无法全面利用时间序列的信息，而分类算法则能够更好地处理非线性和复杂信息。综上所述，轨迹聚类是时域分析中的...
数据库可以解决文件存储存在的问题,支持高效存取和查询大规模的轨迹数据。常见的轨迹数据库有PostGIS、Neo4J等,这些数据库支持轨迹的存储、查询和分析。其中PostGIS是一个基于PostgreSQL的扩展,提供了丰富的空间查询功能,对于轨迹数据的空间关系计算、热力图分析都提供了很好的支持。 二、 长时间轨迹数据的分析 长时间...
嵌入表示形式: 通过the skip-gram 模型得到e(P,t)为轨迹Ti中第t个时间戳的嵌入向量。 处理本质:使用 Skip-gram 模型来学习轨迹数据中的离散化时间戳信息,实质上是在捕捉时间的上下文信息,即时间序列性。 1. Introduction (1) 良好的相似度度量不仅保证了处理低质量轨迹时的鲁棒性,而且实现了较高的效率。前人工...
通过安装在出租车上的GPS设备,可以采集到大量的轨迹数据,从而帮助我们分析人们出行信息,达到优化交通的目的。 最近拓端tecdat研究人员对杭州的出租车轨迹数据从空间和时间维度上进行了分析和展示。 高峰时段打车难 杭州出租车总数并不少。不过每到傍晚时分,市民却普遍感到“打的”难。是下班高峰期,“打的”人士格外多,...
时间最优轨迹规划是指在满足机器人动力学和运动学约束的条件下,寻找一条从起始点到目标点的最优路径,使得机器人执行任务的总时间最短。 1变胞式工业机器人概述 这种机器人的设计灵感来源于自然界中生物的变形能力,例如章鱼能够根据环境变化改变其触手的形状和长度。类似地,变胞式工业机器人通过模块化的设计理念,实现...
单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统.pdf,本发明公开了一种单细胞转录组数据伪时间轨迹的分析方法及计算机系统,其包括:1)计算基因显式比较优势矩阵;2)利用相似度得到基因相识度矩阵,构建基因网络;3)在基因网络中取初始节点,并从初始节点开始随机行走,