在本文中,作者介绍了一种基于RiboTACs的方法进行转录组范围内的无偏倚分析,并评估了针对三种RiboTACs分子的靶标。 传统的RNA-小分子相互作用鉴定方法一般是化学交联和下拉分离(Chemical crosslinking and isolation by pull-down, Chem-CL...
为了确定这些RiboTACs的结合靶标,作者设置了两组对照试验,一组使用CRISPR敲低RNase L,从而去除由RiboTAC诱导的切割,另一组使用对照guide RNA,使RNase L表达量不受影响,从而消除RiboTAC本身造成的转录水平影响。 总体而言,在与所有六种化合物结合的481个RNA靶标中,作者鉴定到5个被相应的RiboTAC分子以RNase L依赖性的...