数据非依赖性采集 (DIA)1,2是一种用于大型靶向蛋白质组学实验的先进技术。在没有采集 预定的情况下,选择反应监测 (SRM) 和平行反应监测 (PRM) 等靶向采集方法仅能测量少量 肽段;在每次质谱运行进行预定的情况下,这些采集方法可测量数十到数百个肽段。而使 用 DIA 时可以测量更多的肽段(数千个乃至整个...
目前,糖肽分析最常用的质谱采集模式是数据依赖性采集(DDA),存在母离子选择随机性的问题,其结果中存在较多的缺失值。近年来出现的数据非依赖性采集(DIA)模式能弥补DDA的缺点,已开始初步应用于糖蛋白质组学领域。然而,现有的糖肽DIA分析方法缺乏可靠的质控,难以处理多种糖肽在隔离窗口中共碎裂的复杂情况。 近日,复旦大学...
在这里,我们将数据非依赖性采集(DIA) MS与ABPP结合起来,开发了一种高效的无标记定量化学蛋白质组学方法,DIA-ABPP,具有良好的重现性和高准确度,可用于高通量定量。我们证明了DIA-ABPP在三种不同应用中对功能性半胱氨酸的综合分析的能...
本发明公开了一种数据非依赖性采集质谱特征碎片的非靶标分析方法,属于化合物非靶标识别技术领域,本发明方法通过数据非依赖性采集模式获得高分辨质谱数据,并将数据转化为通用格式,在二级质谱数据中提取特征碎片离子的色谱图,获得特征碎片离子的保留时间和峰宽信息。在特征碎片离子色谱图的保留时间段内提取一级质谱数据中...
目前,糖肽分析最常用的质谱采集模式是数据依赖性采集(DDA),存在母离子选择随机性的问题,其结果中存在较多的缺失值。近年来出现的数据非依赖性采集(DIA)模式能弥补DDA的缺点,已开始初步应用于糖蛋白质组学领域。然而,现有的糖肽DIA分析方法缺乏可靠的质控,难以处理多种糖肽在隔离窗口中共碎裂的复杂情况。
摘要 数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT 三合一质谱,发展了经典DIA 方法以及WiSIM-DIA 和Full MS-DIA两种全新DIA 方法,并...
目的基于数据非依赖性采集(DIA)质谱技术对注射用曲妥珠单抗(赫赛汀)及其类似药进行结构表征和相似性研究.方法用液相色谱/质谱(LC/MS)对赫赛汀及其类似药的完整蛋白及轻链和重链的相对分子质量进行测定;应用DIA质谱技术进行肽图分析,确定赫赛汀及其类似药的氨基酸全序列.结果LC/MS可准确测定赫赛汀的相对分子质量,赫...
Structural Characterization and Biosimilar Study of Herceptin and Its Analogues by Data Independent Acquisition Mass Spectrometry LI Ke,LI Heng,ZHOU Qing Herald of Medicine . 2022, (4): 519 -523 . DOI: 10.3870/j.issn.1004-0781.2022.04.016 ...
首先,作者在Q-TOF上以50个分子为例,对比了增强源内裂解注释模式(eISA)与数据依赖采集模式(DDA)和数据非依赖采集模式(DIA)产生的二级质谱图。与DDA模式相比: eISA得到的前体离子的峰强更高;对于90%以上的分子,eISA产生碎片的相对强度和质荷比与METLIN上的二级质谱图一致。与DIA模式相比:60%的负电荷前体离子和88...
这个不用怎么设啊,打二级时ddMS2里TopN设置N=5~10,勾上动态排除就可以了。