首先根据细胞发育谱系来绘制热图 因为前面的教程使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育)我们已经把细胞发育情况做出来了,就是NPC细胞跟另外3种细胞从生理上就不一样,所以是单独的发育轨迹,而“GW16” and “GW21” ,“GW21+3” 这种孕期细胞,就可以很清晰的看到时间被反映在我们的拟时序分析结果了。 大家可以重...
绘制拟时序分析top差异基因或一组基因的时序热图,代做生信分析,于2024年10月10日上线。西瓜视频为您提供高清视频,画面清晰、播放流畅,看丰富、高质量视频就上西瓜视频。
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首先根据细胞发育谱系来绘制热图 因为前面的教程使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育)我们已经把细胞发育情况做出来了,就是NPC细胞跟另外3种细胞从生理上就不一样,所以是单独的发育轨迹,而“GW16” and “GW21” ,“GW21+3” 这种孕期细胞,就可以很清晰的看到时间被反映在我们的拟时序分析结果了。 大家可以重...
使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育)用法只是最基础的知识而已,更多的时候,我们需要活学活用,比如课程学员提到的问题,就是因为做不到活学活用,他想知道下面的拟时序分析的热图提取基因,学员把基因按照发育顺序绘制了热图,而这些基因被他分成了3组,想拿基因去做GO/KEGG等数据库进行功能注释,不知道如何获取基因...
拟时序分析的热图提取基因问题 昨天我在单细胞天地讲解了使用monocle2进行拟时序分析的方法,基本上跟着我的代码走一波就可以学会了,当然具体参数理解需要自行发力哦,见:使用monocle做拟时序分析(单细胞谱系发育)用法只是最基础的知识而已,更多的时候,我们需要活学活用,比如课程学员提到的问题,就是因为做不到活学活用,...
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