拓扑结构域(Topologically associating domains,TADs)是基因组织基本单位【1】。CTCF蛋白做为基因组边界,黏连蛋白折叠形成TADs结构。除了TADs外,染色体组成广泛的转录活性区以及非活性区,被分别称为A区室以及B区室。但是更高阶的、更长距离的基因组环是如何调控基因表达并参与神经系统发育的还不得而知。 近日,瑞士洛桑...
*first; if (!sg) return; first = sg; do { //do-while循环,完整遍历sg循环链表元素一次 tmp = sg->next; if (free_sgc && atomic_dec_and_test(&sg->sgc->ref)) //检查引用数是否为1,判断是否要free sgc结构 kfree(sg->sgc); //free sgc结构体 if (atomic_dec_and_test(...
拓扑结构域(Topologically associating domains,TADs)是基因组织基本单位【1】。CTCF蛋白做为基因组边界,黏连蛋白折叠形成TADs结构。除了TADs外,染色体组成广泛的转录活性区以及非活性区,被分别称为A区室以及B区室。但是更高阶的、更长距离的基因组环是如何调控基因表达并参与神经系统发育的还不得而知。 近日,瑞士洛桑...
通过染色质免疫共沉淀测序技术,研究发现拓扑结构域的边界富集了特定的分子,因此这些分子被认为与该结构的形成有很大关系。在这些分子中,富集度最高的是转录因子CTCF和蛋白质复合体黏连蛋白复合物 (cohesin)。CTCF有11个锌指结构,能够以非常高的亲和力与DNA结合。Cohesin是一种环状的大分子复合物,它有一个很有趣的特...
CTCF通过调节拓扑相关结构域(TAD)边界处染色质绝缘强度在3D基因组组织中发挥重要作用,其中成簇的CBS(CTCF结合位点)元件通常排列成具有复杂发散或收敛方向的串联阵列。 2023年12月7日,上海交通大学吴强团队在Nature Communications发表题为“Outwar...
中文译作拓扑关联结构域,是一种首先在哺乳动物细胞中发现的染色质结构单元,对应的文章发表在nature上,文章标题如下 Topological Domains in Mammalian Genomes Identified by Analysis of Chromatin Interactions pubmed的链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3356448/ ...
同济大学张赫团队发表关于染色质拓扑相关结构域调控基因转录新模式的最新研究,细胞,介导,同济大学,基因转录,染色质拓扑,张赫(韩国)
基因组的三级结构可以分为不同层次结构单元,包括染色质疆域(Chromosome Territory,CT),染色质区室(A/B compartments),拓扑结构域 (Topologically associating Domains,TADs),和染色质环 (chromatain loop) 等【1-3】。其中,TAD是基因组上频繁交互的染色质区域,它的一个重要功能是形成基因调控的独立区域,同时,将...
目前广域网基本上采用网状拓扑结构。此外，树型拓扑结构可以看作是星型结构的扩展，它是一种层次结构，节点按层次连结，信息交换主要在上、下节点之间进行，树型结构可以看作是由基本链路组成的，这些链路从两个节点中的某一节点开始，在下一个分支点结束。这种结构的优点是扩充方便、灵活，成本低，易...
中文译作拓扑关联结构域,是一种首先在哺乳动物细胞中发现的染色质结构单元,对应的文章发表在nature上,文章标题如下 Topological Domains in Mammalian Genomes Identified by Analysis of Chromatin Interactions pubmed的链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3356448/ ...