抗原决定簇预测(v1) 抗原决定簇(antigenic determinant)是抗原物质分子表面或其他部位,具有一定组成和结构的特殊化学基团,且能与其相应抗体发生特异性结合的结构。同时,结构已经确定的抗原决定簇被称为抗原表位。 该抗原决定簇预测工具集成了以下五种算法:Chou & Fasman Beta-Turn Prediction,Emini Surface Accessibility...
亲水性、柔韧性、表面可能性和抗原表位预测 应用DNAstar软件的子程序Protean,采用Hopp-Woods和Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性[5, 6],采用Karplus-Schultz和Emini方案预测柔韧性及表面可能性[7, 8],采用Jameson-Wolf方案[9]和吴氏抗原指数法[10]预测潜在的B细胞抗原表位。 5、 对获取序列的生物信息学处理分析...
亲水性、柔韧性、表面可能性和抗原表位预测 应用DNAstar软件的子程序Protean,采用Hopp-Woods和Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性[5, 6],采用Karplus-Schultz和Emini方案预测柔韧性及表面可能性[7, 8],采用Jameson-Wolf方案[9]和吴氏抗原指数法[10]预测潜在的B细胞抗原表位。 5、 对获取序列的生物信息学处理分析...
在线网站预测(http://-bimas.cit.nih.gov/molbio/hla_bind/index.shtml and http://.imtech.res.in/raghava/propred/algorithm.html ) (2)选定:接近N、C 端;选取在此区间内,(Antigenic Index)Jameson-wolf 抗原决定簇选正分高处;(Hydrophilicity plot)Kyte-Doolittle 预测亲水性强的区域。同时符合以上3 点的...
抗原疫苗dna预测计算机决定 上海交通大学硕士学位论文抗原决定簇的计算机预测及在DNA疫苗中的应用姓名:***学位级别:硕士专业:生物化学与分子生物学指导教师:**虹20040201上海交大硕士学位论文2上海交通大学学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经...
摘 要 通过分析氨基酸序列的某些参数,可达到预测抗原决定簇。但没有一种单参数预测 获得较满意结果,故有必要进行多参数联立综合预测。选用6个参数加权叠加。首先假设形成表位 的残基上的原子数正比于N 2 3 (N 为整蛋白中残基原子数),再对34个共含169个已知抗原位点的蛋白进行训练性综合预测,选出最佳权重。结果...
但冬虫夏草中IP4含量低,从冬虫夏草中直接提取制备抗体难以大量获得,限制了试剂盒的规模化开发。基于此本实验克隆了IP4的cDNA全长并预测了其抗原决定簇,为下一步大量转化获得IP4蛋白奠定了基础。 1材料与试剂 1.1材料 新鲜冬虫夏草于2017年5月采...
摘要: 本文对SARS Co-V抗原决定簇的预测和制备进行了研究。预测的表位基因在大肠杆菌中得到了表达,用免疫印迹方法证实了表达的蛋白可以和人抗SARS-CoV免疫球蛋白发生特异性反应。研究表明,通过预测和表达获得可能具有中和抗体表位的SARSCo-VS2蛋白。关键词:
［摘要］目的：分析预测前胃泌素释放肽（ProGRP）蛋白结构及其抗原决定簇，为抗ProGRP单克隆抗体的筛选及其相应的抗原结合位点的确定提供可靠依据。方法：从NCBI网站获取ProGRP不同亚型的氨基酸序列进行比对分析（Clustalw），运用不同生物信息学软件分析蛋白理化性质（Protparam），跨膜区（TMHMM），二级结构、亲水性、表面...