msd扩散系数 MSD（Mean Square Displacement）是指扩散分子在一定时间内移动的平均距离的平方。扩散系数（Diffusion Coefficient）是描述扩散分子运动速度和距离的一个物理量。扩散系数可通过MSD计算得到。在离散的时间点上，扩散分子的位置可以表示为(x(i), y(i), z(i))，其中i为时间点。扩散分子的MSD可以通过以下...
各位老师好，通过MSD计算扩散系数时候有几个点不太明白，假设系统模拟10ns，2ns时平衡 1.手册中gmx ...
运行扩散系数计算: pythonli_conductivity.py 报错1: from pymatgen importStructure报错显示找不到Structure. 解决方法:from pymatgen import Structure改成了“ from pymatgen.coreimport Structure 参考:朋友阿木木:pymatgen安装以及msd和扩散系数的计算(AIMD) 报错2:显示没有analysis.diffusion_analyzer。 解决方法,...
[Materials Studio] Forcite模块篇 第4讲 RDF 配位数 MSD 扩散系数共计4条视频,包括:1_基本介绍和知识储备、2_MSD和扩散系数、3_RDF和配位数(手算)等,UP主更多精彩视频,请关注UP账号。
Pymatgen的骚操作系列(计算离子电导率)在大师兄这篇安装pymatgen的基础上亲测会出现报错的一些过程 conda安装正常, 安装完成之后 vi ~/.bashrc export 一下conda 的路径,source ~/.bashrc(否则下一步显示cond…
2_MSD和扩散系数 08:45 3_RDF和配位数(手算) 10:26 4_脚本算RDF和配位数 03:54 03-信息建模与RDF 4164播放 Materials Studio Forcite模块-RDF径向分布函数分析 8354播放 分子动力学模拟-RDF数据处理 1.4万播放 东南大学周扬博士_基于分子动力学的水化硅酸钙的微结构与性能研究 3796播放 VMD教程-VMD中蛋白质...
影响扩散的因素 1. 温度，温度越高，越易扩散。 2. 金属键的键能，键能越弱，越易扩散。 3. 在间隙固溶体中，扩散激活能较小，原子扩散较快；在置换固溶体中扩散激活能比间隙 扩散大得多。 4. 金属晶体的原子堆叠方式。越疏松，越易扩散。
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前言:为了将区域地层的压力预测与随钻压力监测有效地结合起来,使石油勘探开发过程中从地质设计开始就有可靠的数据依据,论述了利用声波测井曲线进行压力计算的方法原理、等深度法计算地层压力的方法和步骤。这些方法值得现场录井工程师借鉴。
用utility里面的msdblk.f处理HISTORY文件，得到的输出结果。用输出结果的前两列做MSD随时间的曲线，对...