扩增子分析是目前宏基因组研究中最常用的技术,由于微生物组受环境影响大,实验间重复较差,更需要更多的实验重复和分析技术来保证结果的准确性、可重复性。 本系统文章叫分析解读,即有详细的分析代码和参数,又有本人对这些参数意义的解读,可以让大部分人零基础的人,更好的理解数据分析过程,并可亲实践在自己的课题上,...
本文采用目前最主流的扩增子测序数据类型HiSeq2500 PE250类型数据为例,结合目前主流方法QIIME+USearch定制的分析流程。本课程中所需的测序数据、实验设计和课程分析生成的中间文件,均可以直去百度云下载。链接:http://pan.baidu.com/s/1hs1PXcw 密码:y33d 本课程代码的运行,至少需要Linux平台+安装QIIME 1 分析前准...
宏基因组学目前的主要研究方法包括:微生物培养组学、16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组、宏蛋白组和宏代谢组,其中以扩增子研究最为广泛。本系列文章将结合较新的16S扩增子相关文献,来理解宏基因组16S扩增子文章中常用图表种类、图中包括的基本信息,以及作者想表达的结果。由于方法原理相同,对其它类型测序数据结...
澎湃_L 0 101 inux 磁盘监控分析 2019-12-18 17:03 −一、查看磁盘空间 1、 df -h Size 分割区总容量 Used 已使用的大小 Avail 剩下的大小 Use% 使用的百分比 Mounted on 路径地址 2、查看目录的空间 du -sh ... 小禾点点 0 507 <123>
扩增子分析是目前宏基因组研究中最常用的技术,由于微生物组受环境影响大,实验间重复较差,更需要更多的实验重复和分析技术来保证结果的准确性、可重复性。 本系统文章叫分析解读,即有详细的分析代码和参数,又有本人对这些参数意义的解读,可以让大部分人零基础的人,更好的理解数据分析过程,并可亲实践在自己的课题上,...