本视频是根据9.1视频David数据库获得的通路进行疾病-通路-靶点-成分-药物网络的构建,主要对Nenwork,tape文件进行讲解。对需要进一步完善数据的伙伴有参考意义。, 视频播放量 11.2万播放、弹幕量 146、点赞数 997、投硬币枚数 388、收藏人数 3140、转发人数 1047, 视频作者
将在中药成分的潜在靶点以及相应调整后的P值和映射到该术语的靶标中的KEGG生物学富集,GO功能术语(包括生物学过程,分子功能和细胞成分)和OMIM疾病表型/ TTD疾病将成为显示在结果表中。 KEGG生物学富集: 疾病:中医是针对特定的“疾病模式”(中文为“ zheng”)开处方的,而现代西方药物则是为治疗特定疾病而设计的。中...
点击化合物性质旁边的漏斗标志可以进行筛选。所有化合物均具有3D结构,可以直接下载,分子页面中有名称,结构,性质,各个数据库编号,别名,相关联的疾病、靶点和相关中药,如下: 在Molecule Name列点击成分名称,可以跳转至成分的详细网页,点击成分图形可以保存为mol2格式文件(后续处理),点击下方PubChew Cld行可以跳转至PubChew...
TCMSP,这个医药界的瑰宝,如同一座桥梁,连接着药物、生物靶点和疾病,为中药研究者揭示了前所未有的洞察。它不仅仅局限于传统草药的范畴,而是通过其庞大的499种草药及29000多个活性成分库,让你轻松触及自然界的治疗宝藏。在化合物检索部分,以甘草为例,只需输入分子名或CAS号,你就能得到详尽的信息。...
目的 基于质量标志物(Q-marker)概念,通过筛选脑心通胶囊Q-markers,构建活性化合物-靶点网络,建立脑心通的整体质控方法。方法 采用多元统计方法找到多批次脑心通胶囊的特异性成分,运用基于BATMAN-TCM网络药理学计算平台构建“Q-markers-靶点-通路-疾病”网络,并进行生物学信息注释。进一步建立超高效液相色谱法(UPLC)同...
利用该模型对川芎26个化学成分进行靶点预测,并构建其成分-靶点-疾病网络,所得结果得到了较好的文献验证。该文所建模型具有较高的预测精度,可用于发现其他中药成分的潜在作用靶点。 标签:网络药理学;靶点预测;川芎;心脑血管疾病 川芎为伞形科植物川芎Ligusticum chuanxiong Hort.的干燥根茎,具活血行气、祛风止痛的功效,...
6. 1 软件构建 “成分-靶点-疾病”网络,预测藤茶黄酮类成分可能干预的疾病。结果:建立藤茶化学成分数据库,收集到 136 种化合物,运用 ADME 最终筛选到 8 个黄酮类成分,对应 430 个潜在作用靶点。对藤茶黄酮类成分体内潜在的作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果显示,其潜在...
目的 基于质量标志物(Q-marker)概念,通过筛选脑心通胶囊Q-markers,构建活性化合物-靶点网络,建立脑心通的整体质控方法.方法 采用多元统计方法找到多批次脑心通胶囊的特异性成分,运用基于BATMAN-TCM网络药理学计算平台构建"Q-markers-靶点-通路-疾病"网络,并进行生物学信息注释.进一步建立超高效液相色谱法(UPLC)同时质...
目的应用监督学习算法中的随机森林算法构建药物-靶点模型,预测延胡索治疗心脑血管类疾病的关键靶标.方法训练集从KEGG数据库获取,包括药物-酶,药物-离子通道,药物-G蛋白,药物-核蛋白四类药靶数据,采用随机森林算法构建药靶模型并预测延胡索体内作用靶点,应用Cytoscape软件构建延胡索成分-靶点-疾病网络;其中模型精度利用十折...
下载: 全尺寸图片 幻灯片 成分靶点与疾病靶点交集的维恩图 2021, 42(14): 8-15. 基于网络药理学探讨预知子抗抑郁的作用机制 . 本文全文图片 成分靶点与疾病靶点交集的维恩图 化合物-靶点网络 PPI网络 GO富集分析结果 预知子抗抑郁通路的气泡图 结合能最低的分子对接模式 ...