本文全文图片 益肾通络方-DMED的Venn图 “中药成分-靶点”网络图 益肾通络方与DMED蛋白-蛋白相互作用网络图 前20位核心靶点相互作用图 GO富集分析图 KEGG富集分析图 核心靶点与核心成分的分子对接 各组阴茎海绵体HE染色病理形态学表现(200×) ...
通过GeneCards、OMlM 和 Disgenet 等资源,获取与特定疾病相关的靶点信息。 🔗 绘制韦恩图: 使用微生信和 VNEEY 等工具,找出药物和疾病之间的交集靶点,并绘制韦恩图以直观展示这些关系。 📊 绘制PPI网络互作图与核心靶点: 利用STRING、Cytoscape 和其插件(如 CytoNCA 和 Sentiscape),构建蛋白质相互作用(PPI)网络...
Tricin对PRKCA和PRKCB具有调节作用,从而进一步影响NSCLC通路(图1)。 图1 中药-成分-靶点-通路网络图 表1 排名前十枢纽蛋白 2、WJD抑制LLC肺癌肿瘤生长并延长小鼠生存期 研究采用异种移植小鼠模型评价药物疗效。通过免疫组织化学和定量PCR发现,WJD能抑制肿瘤生长、下调肿瘤基因水平,并延长小鼠生存期(图2)。 图2 异种...
图7 药物-疾病蛋白质相互作用网络 图8 蛋白质相互作用的核心网络 ZSSE治疗失眠的GO和KEGG富集分析 对116 个靶点进行GO富集分析。结果显示,ZSSE的相关靶点富集在1 922 个GO注释,主要涉及类固醇代谢过程、激素水平调节与代谢、突触膜的细胞组成、神经元胞体、血红素结合、突触后神经递质受体活性、神经递质受体活性等BP...
应用cytoscape 3.6.1构建药物-活性成分-疾病-靶点互作网络(图2),共包括61个节点(药物2个,活性成分20个,靶点38个,疾病1个)和610条边。 2.5黄芪-当归改善血管内膜增生的核心通路筛选 应用R对共同靶点进行GO分析,得到柱状图和气泡图见图3...
此外,SymMap通过症状-疾病关联或成分-靶标关系收集了这些草药的相关靶标(基因)和疾病,总共包含了4,302个靶点和5,235个疾病。所以SymMap可提供大量有关草药,中医症状,MM症状(现代医学中使用的症状),成分,目标和疾病的描述性信息。它还通过直接关联或间接统计推断在所有这六种类型的组件之间提供成对关系:草药-中医...
复现网络药理学 3.1富集分析GO(BP+CC+MF)微生信多气泡图 621 -- 22:54 App 复现网络药理学 2.2Cytoscape靶点蛋白互作网络PPI 374 -- 4:46 App 用cytoscape画靶点通路图 4万 29 5:04 App cytoscape 做成分-靶点-通路-疾病-图 416 -- 7:35 App 复现网络药理学 1.2活性成分治疗的全部靶点 319 --...
为证明药物活性成分与疾病靶点蛋白间的结合活性,选取蛇床子治疗阿尔茨海默病得分前5位的核心成分β-谷甾醇、豆甾醇、邻-异戊酰基二氢山芹醇、O-乙酰二氢欧山芹酯、蛇床子素与核心靶点Bcl-2ESR1、PTGS2、GSK3B、CASP3分别进行分子对接,见图7。将对接结合能最小的4组组合进行三维结构成像,见图8。结果提示,化合物与...
2.3“中药–活性成分–靶点–疾病”网络的构建与分析 通过Cytoscape 3.7.2软件构建心可舒片治疗高血压的“中药–活性成分–靶点–疾病”网络,见图2,该网络包括415个节点,3 187条边。利用“Network Analyer”插件,以degree值、中介中心性、紧密中心性大于平均值为条件进行筛选,最终获得15个关键活性成分,见表2。其中...
将枸杞子活性成分、潜在靶点与疾病通路富集分析结果进行映射,导入Cytoscape 软件,构建“药物-成分-靶点-通路-疾病”网络图。 1.6 实验验证 1.6.1 细胞株 人视网膜色素上皮细胞ARPE-19和小鼠小胶质细胞系 BV2 均购自上海赛百慷公司。 1.6...