GSEA分析: 点击Run GSEA, 然后选择想要分析的样品的表达量和分组。 然后根据需求选择合适的Gene sets database: 这一项是怎么处理你的重复的基因名的,如果你的数据是micro array的,你可以选择Collapse,如果你的数据是RNAseq你最好选择Remap。 Collapse选项是用于将基因表达数据中映射到同一基因的多个探针(或转录本)合...
图1 “GSEA富集分析工具”主界面 三、操作说明 1、上传蛋白表达谱文件。若在景杰做过组学项目,可直接输入项目标准分析中“2-Basic_analysis”文件夹下MS_identified_information.txt文件: 图2 上传蛋白表达谱文件 2、拖动想要分析的比较组,点击"OK": 图3 选择需要分析的比较组 3、选择KEGG注释文件,点击OK,填入...
首先，你需要准备好表达量表和Phenotype的表。表达量表包含基因名、样品名以及基因在各样品中的表达量。注意，数据需要经过标准化处理。Phenotype的表记录了样品的分组情况。接着，使用文本编辑器创建包含样品数、分组名称和样品分组的文件，并保存为.txt格式，然后将其更改为.cls后缀。确保文件名与GSEA要求相...
GSEA基因富集分析 基因集富集分析GSEA(gene-set enrichment analysis)。这个操作并不难,主要就是准备符合GSEA要求的数据文件(本地的话4个),关于文件准备,可细见官方说明。最主要的还是GSEA结果解读。 可以看到我们只要按照操作步骤一步一步即可得到GSEA的分析结果。 但是当我们...
GSEA定义 Gene Set Enrichment Analysis(基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势,从而判断其对表型的贡献。其输入数据包含两部分,一是已知功能的基因集 (可以是GO注释、MsigDB的注释或其它符合格式的基因集定义),一是表达矩阵,软件会对基因根据其与表型的关联度(可...
如果芯片中没有Gene Symbol 的注释信息，可以细看一下注释文件中是否有其他的ID ，再看看其他的ID能否...
你再对比一下课程示例文件格式
0 人做过这道菜 收藏 wingsea 用料 猪大排 两块 葱姜蒜干辣椒八角 适量 红烧大排的做法 猪大排泡水至干净为止 用料酒胡椒粉腌制半个小时 锅里热油煎猪排至八九分熟 留底油爆香葱姜蒜辣椒和八角并放入煎好的大排,放盐十三香等调料然后放老抽上色炒一会,放水然后烧开后小火炖熟(时间自己掌握)...
也可以去医院心理科做个更专业得量表评分,过度劳累,或者焦虑症都可以引起乏力的感觉,乏力实在担心化验肌酸激酶,甲功,电解质,没事的话一般身体没啥生理性疾病,有可能的,去医院心理科做了评估看看,搬东西也就是活动运动谁也会心率增快的,也会累,这个是正常反应,这个不算焦虑,但您过度关注这个症状的话有可能是焦虑...
这种情况跟频繁xx有一定的关系,因为频繁xx,会提高阴茎的阈值,降低龟头的敏感度和硬度,如果有这种情况的,建议降低xx的频率。 患者 如果是心理障碍怎么治疗呢 潘恩山医生 寻求心理医师的治疗 扫码查看完整对话内容 提示:疾病因人而异,他人的咨询记录仅供参考,擅自治疗存在风险。 咨询时间: 2014-02-17...