筛选差异表达基因集(Different Expression Gene set,DEGs)的有效性等等.目前作了以下工作: 1.简要介绍微阵列实验基本概念,基因集注释数据库和单基因分析方法.在此基础上广泛复习和评价国内外有关微阵列数据的基因集分析方法.按照基因集的定义,统计原假设框架与统计量理论分布的生成回顾和综述了基因表达谱富集分析方法....
集成SVM在微阵列数据分析中的应用
基于ICA的集成学习系统在基因微阵列数据分析上的应用研究,基于ICA的集成学习系统在基因微阵列数据分析上的应用研究基于ICA的,基于ICA的
需要两个准备文件,芯片或者测序表达矩阵以及参考数据集。表达矩阵格式第一列是基因名,第一行是样品名,不能有重复基因名,第一列列名不能空白。矩阵中不能存在空白或NA值,不要对表达量取Log2。二、ImmuCellAI-mouse链接 这是一个 国人开发的工具 ,根据RNA-Seq或微阵列数据的基因表达谱计算36个免疫细胞丰度的工具...
《基于集成学习的高维癌症基因微阵列数据分析方法研究》是依托厦门大学，由刘昆宏担任项目负责人的青年科学基金项目。项目摘要 肿瘤是一种目前还未明确发病机理的严重危害人类生命健康的分子疾病，而基因微阵列技术为从分子水平上研究其发病机理与临床诊断方法提供了强有力的手段。本课题重点研究基于肿瘤基因表达谱的数据分析...