全基因组关联分析(Genome-Wide Association Analysis Study, GWAS)作为一种有效的手段已经被用来研究宿主和微生物组之间的关 系.本文基于国内外最新研究进展,从以下方面进行综述,包括植物对微生物组的调控,以及如何应用 GWAS 研究植物与微生物 组互作遗传机制,重点阐述了植物与微生物组关联分析中微生物组作为"拓展表型...
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而由于宿主基因型差异而改变的植物微生物组,同样影响着植物的健康,可以将微生物组的差异作为植物的“拓展表型”,并利用关联分析找到影响植物微生物组的基因,为分子育种等提供重要的理论基础和遗传资源,是未来研究方向的热点。在植物与微生物组 GWAS 分析中,如何表征微生物组差异并用于后续关联是保证结果准确性的关键以...
近日,浙江大学土水资源与研究所马斌课题组与茶叶所徐平课题组合作发文,通过综合分析100个茶树品种基因组,以及茶树叶际、根系内生、根际微生物群落,在宿主-微生物共生组学(Holo-omics)的理论框架下,运用微生物组全基因组关联分析(microbiome...
Nature子刊全基因组关联分析揭示肠道微生物群的改变有助于颅内未破裂动脉瘤的进展 推荐:江舜尧 编译:小鹿同学 编辑:小菌菌 中国医学科学院和北京协和医学院国家心血管疾病研究中心阜外医院心血管疾病国家重点实验室陈敬洲研究员等人于2020年6月25日在国际顶级期刊Nature Communications发表题目《Alterations of gut microbiota...
随着测序技术和统计学的最新进展,GWAS 已成为有效方法来识别与微生物组相关的植物遗传变异,并且已经被应用在多种植物上。GWAS是利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记,鉴定与复杂性状表型变异相关联的分子标记,进而挖掘与表型相关基因的方法。宿主由于基因型的差异直接影响了表型的变化,因此,GWAS 已经被广泛应用于动...
近日,《生物技术通报》在线发表了《全基因组关联分析研究植物与微生物组的互作遗传机制》文章。本文基于国内外最新研究进展,从以下方面进行综述,包括植物对微生物组的调控,以及如何应用 GWAS 研究植物与微生物组互作遗传机制,重点阐述了植物与...
植物微生物组群落的结构和功能等方面已得到了深入细致的研究,而植物与微生物组的互作机制仍有待探索。全基因组关联分析(Genome-Wide Association Analysis Study, GWAS)作为一种有效的手段已经被用来研究宿主和微生物组之间的关系。本文基于国内外最新研究进展,从以下方面进行综述,包括植物对微生物组的调控,以及如何应用...