近期,香港城市大学李帅成课题组连续在Nucleic Acids Research发布了三个重要的生物信息学数据库:PhageScope、PlasmidScope和GutMetaNet,分别针对肠道微生物组中的基因水平转移和功能冗余、噬菌体基因组以及质粒序列进行系统性注释和分析,为微生物组学研究提供了强大的工具支持。 PhageScope:全面注释与自动分析的噬菌体数据库 ...
R包合辑)、扩增子常用数据库(QIIME/USEARCH的使用的GG/RDP/SILVA/UNITE)、宏基因组软件常用参考数据库(KneadData、HUMAnN2/3、Kraken 2、MetaWRAP、GTDB、eggNOG、CAZy),都可以通过国家微生物科学数据中心的云平台高速下载了!
融智生物科技（青岛）有限公司（以下简称“融智生物”）近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。据介绍，基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）已广泛应用于欧美等发达国家以及我国的三甲医院、省市级食品安全监管机构等。结合了该方法的质谱在业内被称为...
NR数据库是NCBI中的一个非冗余的蛋白数据库。它包含从GeneBank核酸序列翻译而来的非冗余序列,并且还收录了其他蛋白数据库的非冗余序列,包括RefSeq、PDB、SwissProt、PIR和PRF。截至2015.04.26,NR数据库共收录的序列数为65,519,838,提取其中属于微生物(Bacteria,Archaea,Viruses,Fungi)的序列数目为52,375,954,这些序列...
科技日报讯 (记者操秀英)融智生物科技(青岛)有限公司(以下简称“融智生物”)近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。 据介绍,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已广泛应用于欧美等发达国家以及我国的三甲医院、省市级食品安全监管机构等。结合了该方法...
全球首个商用生物组学微生物质谱数据库建成 科技日报讯 (记者操秀英)融智生物科技(青岛)有限公司(以下简称“融智生物”)近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。 据介绍,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已广泛应用于欧美等发达国家以及我国的三甲医...
科技日报青岛7月18日电 (记者王建高 通讯员张永艳)7月18日,青岛市科技局发布,由青岛市工研院在孵企业融智生物科技(青岛)有限公司建设完成了基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用化生物组学微生物质谱数据库。 拥有先进科学仪器和生命科学背景的融智生物创新性地利用了新的微生物数据库理念,...
全球首个商用生物组学微生物质谱数据库建成 科技日报讯 (记者操秀英)融智生物科技(青岛)有限公司(以下简称“融智生物”)近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。 据介绍,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已广泛应用于欧美等发达国家以及我国的三甲医...
科技日报讯 (记者操秀英)融智生物科技(青岛)有限公司(以下简称“融智生物”)近日宣布建成基于生物组学的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商用生物组学微生物质谱数据库。 据介绍,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)已广泛应用于欧美等发达国家以及我国的三甲医院、省市级食品安全监管机构等。结合了该方法...
IMG(Integrated Microbial Genomes,https://https://img.jgi.doe.gov/cgi-bin/m/main.cgi/m/main.cgi)由美国能源部联合基因组研究中心(Joint GenomeInstitute,JGI)于2005年创立,是综合的微生物基因组数据库及比较分析系统。IMG收录了细菌、古菌、质粒、病毒以及少量真核生物基因组数据,其数据主要来源于NCBI的RefSeq...