PGCGAP是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道,该管道包含12个模块,可以接受Illumina双端reads、Oxford reads或PacBio reads作为输入,可以完成基因组组装、基因预测和注释,并可以进行比较基因组学分析,包括构建单拷贝核心蛋白进化树以及单拷贝核心基因SNPs进化树,基于Multi-FASTA序列构建进化树,泛基因组分析,全基因...
统计分析方法:介绍了统计分析中的一些方法,包括t test、ANNOVA等,并提供了相关软件实现。 01:10:54 代谢物显著性分析:介绍了代谢物显著性分析的方法,包括limit cycle analysis和火山图等。 代谢组学中的数据分析方法,包括t检验、火山图、pca分析等,以及如何筛选重要代谢物。01:11:15 数据分析方法选择与结果解释 ...
1-ggplot2等R包的使用与绘图上(生物、医学等方向) 2:45:33 2-ggplot2等R包的使用与绘图下(生物、医学等方向) 2:01:36 3-R语言与转录组学(上) 1:48:32 4-R语言与转录组学(下) 2:02:20 5-R语言与微生物组学(上) 1:54:46 6-R语言与微生物组学下 2:12:46 7-R语言与代谢组学(上) 1:54...
代谢组学的基本概念和研究步骤,以及代谢组数据的特点。代谢组学是研究生物体系中所有代谢产物的变化,可以反映机体系统的生理和病理状态。代谢组数据具有高噪声、高...