要进行微生物环境因子分析,我们需要两个文件,一个是微生物多样性的OTU表格,另一个就是你所有样品的环境因子数据。比如,你进行土壤微生物研究,这时候你就需要知道你所测土壤的C,N,P,K等化学元素含量以及不同样地的气候信息等等,总之,在分析之前可以多准备些环境因子数据,后期我们还可以对这些环境因子进行共线性,以...
distance-based redundancy analysis (db-RDA) 是目前在微生物领域应用的最为广泛的环境因子分析,该分析方法内置在R中的vegan包中。相信大家一定都知道vegan包,该R包是进行生态学(包括微生物多样性分析)研究的必备神器!vegan包中提供了所以基本排序分析的方法,可以说是一包在手搞定所有!关于vegan包的详细介绍,请大家...
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db-RDA 介绍 distance-based redundancy analysis (db-RDA) 是目前在微生物领域应用的最为广泛的环境因子分析,该分析方法内置在R中的vegan包中。相信大家一定都知道vegan包,该R包是进行生态学(包括微生物多样性分析)研究的必备神器!vegan包中提供了所以基本排序分析的方法,可以说是一包在手搞定所有!关于vegan包的详...