构建了包含5046个宏基因组组装基因组(MAGs)的Caprinae肠道微生物物种集,其中2530个属于未培养的候选物种。这些基因组在很大程度上扩展了Caprinae肠道中当前微生物的基因组库,丰富了对Caprinae肠道微生物群的分类、功能和代谢多样性的理解,为动物生产和动物健康的未来研究提供了基础。 文章标题:来自羊亚科肠道微生物群的50...
NC文献解读 | 应用长读+短读测序技术构建新加坡人群高质量的肠道微生物Ref-宏基因组图谱 贝纳基因 人类肠道宏基因组代表了一个具有强烈科学意义的领域,因为它们与各种癌症,代谢,免疫和神经系统疾病疾病有关。现有研究表明,在与各种疾病的宏基因组关联方面可能存在关键的人群特异性差异。本研究利用混合组装(使用短读和...
近年来,随着细菌单细胞测序技术的开发,研究者突破了微生物单个个体RNA含量低及缺少通用扩增识别片段[如真核细胞信使RNA (message RNA,mRNA)的poly-A片段]的技术局限,拥有了更多、更精细化的手段来研究细菌、真菌等人体密切相关微生物。区别于宏基因组研究,单细胞测序无需对微生物的已有知识就可以对单个微生物进行测序...
综上所述,这些发现证实了Melonnpan能够在广泛的化合物中提供代谢相关的预测,识别肠道微生物群-代谢组学轴的重要贡献者,进而促进对微生物群的大规模综合多组学分析。 5.对人体和环境微观生物的推断。 最后,我们将Melonnpan应用于三对16s和代谢组学数据集,以说明Melonnpan能够从各种微生物环境和分析类型中获得生物学...
应用单细胞测序技术(以单细胞转录组测序为主)来研究传染病患者的血液、痰液等组织,有助于分析感染过程中的免疫图谱及相应的免疫信号通路、鉴别新的免疫细胞亚型和传染病生物标志物;而对于微生物的单细胞水平测序和生物信息学分析则对检测未知病原微生物及了解其遗传信息起到关键性作用。在单细胞水平认识宿主和微生物...
本研究使用超深宏基因组测序表征了来自中国6个省的30只羊亚科(Caprinae)动物的肠道菌群。构建了包含5046个宏基因组组装基因组(MAGs)的Caprinae肠道微生物物种集,其中2530个属于未培养的候选物种。这些基因组在很大程度上扩展了Caprinae肠道中当前微生物的基因组库,丰富了对Caprinae肠道微生物群的分类、功能和代谢多样性...
NC文献解读 | 应用长读+短读测序技术构建新加坡人群高质量的肠道微生物Ref-宏基因组图谱 人类肠道宏基因组代表了一个具有强烈科学意义的领域,因为它们与各种癌症,代谢,免疫和神经系统疾病疾病有关。现有研究表明,在与各种疾病的宏基因组关联方面可能存在关键的人群特异性差异。本研究利用混合组装(使用短读和长读)和...
应用单细胞测序技术(以单细胞转录组测序为主)来研究传染病患者的血液、痰液等组织,有助于分析感染过程中的免疫图谱及相应的免疫信号通路、鉴别新的免疫细胞亚型和传染病生物标志物;而对于微生物的单细胞水平测序和生物信息学分析则对检测未知病原微生物及了解其遗传信息起到关键性作用。在单细胞水平认识宿主和微生物...