1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意:用此方法只建议进行 mRNA和lncRNA的基因表达引物查找。 一、mRNA引物序列查找 步骤都在图上,这里就不做多的说明啦~ 二、LncRNA引物序列查找 详细帖子点击用NCBI查找已公布的引物序列,3秒钟就能带你完美找到~学习...
第一步,打开DeepBio官网。选择”核酸序列智能查询系统“,输入目的基因的名称(以EGFR为例)。 第二步,在基因展示列表选择好目的基因,我们以Mouse的Egfr为例。 第三步,页面左侧根据自身需求选择实验条件,右侧点击+号即可复制引物序列。 如果对结果存疑,我们也可以复制文章title,找到文献进行验证。以上述引物为例,找到原...
最后唠叨一句: 最近我实验比较忙, 只能在深夜发帖, 可能要过几天再发第三部分[Part three 运用STS 查找已经公布的引物序列],希望“期待下集”的朋友可以理解。 第三部分 运用STS 查找已经公布的引物序列 STS,序列标签位点(Sequence Tagged Site):一段短的DNA 序列(200-500 个碱基对),这种序列在染色体上只出现...
2. 输入文献中的引物序列: 3. 等待片刻,得到blast的结果: 我们在阅读文献的时候,会关注里面的一些基因,并且想通过下载这些基因序列进行进一步分析。但是,由于文章中的基因序列并没有给出所在的数据库的登录号,因此我们并不能直接知道文章作者中研究的完整CDS序列。但是,我们可以利用NCBI网站上的Primer-Blast工具,根据...
一、使用NCBI查找基因的ID 网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 1.在“All Databases”中选择“...
2187 -- 1:01 App 登陆GenBank查找基因并比对序列教程 17.5万 147 10:44 App NCBI 引物设计及 检验引物特异性 388 -- 1:26 App NCBI查引物 1298 -- 7:02 App NCBI-基因的CDS序列获取 1042 -- 3:10 App 快速通过NCBI网站设计引物 4.2万 21 6:48 App 生物信息学分析:基因序列、蛋白质序列...
首先访问NCBI的Primer-Blast工具网站。接着，输入文献提供的引物序列，包括序列、扩增参数、产物长度等详细信息。提交信息后，稍等片刻，系统将返回blast结果。点击结果进入，即可查看与引物匹配的基因详细信息。在信息页面，找到并关注CDS序列的区间，例如从第128位碱基到第1492位碱基。欲深入了解具体操作方法...
grep查找引物序列 佳名关注IP属地: 宁夏 0.0922021.05.12 21:06:37字数 32阅读 1,135 V3-V4测序引物 341F:CCTACGGGNGGCWGCAG 805R:GACTACHVGGGTATCTAATCC zcatFA1_R1.fastq.gz|head-n100|grepCCTACGGG[AGCT]GGC[AT]GCAG F引物.png zcatFA1_R2.fastq.gz|head-n100|grepGACTAC[^G][^T]GGGTATCTAATCC...
进入页面后将上下游引物录入 下拉根据需求设置，然后开始blast就好 引物blast，结果会直接给你写明产物的...
从引物序列出发查找pcr产物的内容和在基因组上的位置 1.利用primer_blast工具,找出这对引物序列在基因组上的位置: 结果大概会像这样: 2.这些结果都是根据hg38基因组来定位的,转换成hg19: 利用UCSCde hgLiftover 在线软件:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver...