1. 邻接法（NJ法）：这种方法通过计算各物种间的最小进化距离来构建进化树。它的优点在于计算过程简便，易于理解。然而，NJ法对异常值较为敏感，可能导致树形偏差。2. 最大似然法（ML法）：ML法通过最大化观察数据在进化树上的概率来构建树。它能够在考虑数据变异性的基础上，给出最可能的进化树。...
邻接法（NJ法），最大似然法（ML法），贝叶斯法（BI法）是目前主流的建树方法，MP法目前相对用得较少，每种方法都有它一定的优点，同时也存在着缺点。对于相同的数据集，推荐用两种及两种以上的方法建系统发育树进行分析，互相比照。这四种方法的特点和区别总结如下：详细教程请见：（关注we-ch...
建树需要根据自己的研究内容选择合适的建树方法。 一般,如果有合适的分子进化模型,选择ML法获得的结果较好;对于近缘物种序列,通常用ML法;对于远缘物种序列,一般使用NJ或ML法;对于相似度很低的序列,NJ法往往会出现LBA(long-branch attraction,长枝吸引)现象,有时会严重干扰进化树的构建。
建树方法比较和选择..距离法:一种纯数学算法,通过序列两两之间的差异决定发育树的拓扑结构和枝长,将发育树的构建和最优树的确定融合在一起.优点:运算速度快;缺点:在将原始数据转换为距离矩阵时会丢失一些进化信息;最大简约法:能
NJ-MP-ML-BI建树方法的比较-如何让选择合适的建树方法 http://lucky-boy.ys168.com/ 标签:进化树生物信息 分类:系统发育建树 方法 基本特征 适用范围 优点 缺点 NJ 不需要分子钟假设,是基于最小进化原理,进行类的合并时,不仅要求待合并的类是相近的,而且要求待合并的类远离其他的类。 远缘序列,进化距离不大...
这说明,即使有些天资比较差、反映比较迟钝的人,只要有勤奋好学的精神,同样也是可以弃拙为巧,变拙为灵的。 实践证明,勤奋是点燃智慧的火把。一个人的知识多寡,关键在于勤奋的程度如何。懒惰者,永远不会在事业上有所建树,永远不会使自己变得聪明起来。唯有勤奋者,才能在知识海洋里猎取到真...
《梦溪笔谈》在众多科技领域都颇有建树。如用比较色泽及比重的方法判定了陨石的成分是铁,还指出胆矾(硫酸铜)溶液在铁锅中加热会出现置换反应。据此可知,宋代科技()A.注重经验积累和总结-e卷通组卷网
我说有的人主动锁死了自己的思考功能,把自己变成一个绝对听从指挥的工蜂,这是对的,因为那是他们唯一获得食物的方法,可是你要争取有很多的方法获得食物。最后我跟他说了偶像和崇拜,我说我没有偶像,也不崇拜任何人,可以学习有建树的人的经验,知识,甚至观点,但不能崇拜,因为崇拜意味着服从,那会让出思考的权力,这...
四种建树方法比较 标签:生信分析,系统发育,进化树 邻接法(NJ法),最大似然法(ML法),贝叶斯法(BI法)是目前主流的建树方法,MP法目前相对用得较少,每种方法都有它一定的优点,同时也存在着缺点。对于相同的数据集,推荐用两种及两种以上的方法建系统发育树进行分析,互相比照。
标签:生信分析,系统发育,进化树 邻接法(NJ法),最大似然法(ML法),贝叶斯法(BI法)是目前主流的建树方法,MP法目前相对用得较少,每种方法都有它一定的优点,同时也存在着缺点。对于相同的数据集,推荐用两种及两种以上的方法建系统发育树进行分析,互相比照。 这四