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之前一直用MEGA转换多重序列比对的文件格式,但是前两天转换的格式去建树时一直报错,所以学习了一种新的序列格式转换的工具ALTER。 Linux系统安装ALTER,需要安装先JAVA和mvn。 git clone https://github.com/sing-group/ALTER.git cd ALTER mvn package 安装完成后输入 java -jar alter-lib/target/ALTER-1.3.4-jar...
单字母蛋白序列转换工具可以将三字母蛋白序列转换成单字母蛋白序列。数字、空格会自动清除。没标准的三字母被忽略。
return 'A' # RNA中的U互补是A else: return base def reverse_sequence(sequence): return sequence[::-1] def reverse_complement(sequence): return ''.join(complement_base(base) for base in reverse_sequence(sequence)) def dna_to_rna(dna_sequence): return dna_sequence.replace('T', 'U') de...
一、JSON 序列化工具 二、JSON 手动序列化 三、根据 JSON 编写 Dart 模型类 四、在线自动转换 五、相关资源 一、JSON 序列化工具 JSON 格式比较简单的话 , 使用自带的 dart:convert 包 , 手动进行 JSON 的序列化与反序列化的操作...
在线序列转换的工具: Nucleotide Sequence Translation Protein Sequence Back-translation http://bio.lundberg.gu.se/edu/translat.html http://www.ebi.ac.uk/Tools/st/ http://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/TRANSLATE/translate.html Python 序列转换 beans = "TGACTGTGTTTCTGAACAATAAATGACTTAAACCAGGTATG...
字节序列→字符串(Unicode) 编码解码 编码转换 散列/哈希 交换 执行 声明:本网站仅为软件开发者提供测试工具,请勿输入任何隐私信息,请勿用于其他用途! 由于其他用途所产生的一切后果本站概不负责,使用即代表你同意本声明! 本站开源地址:github,仅供学习交流。 首页 粤ICP备11054279号 ...
图片序列转换成视频 最近一直在找一个工具,能够将一堆图片转化成视频。网上找了一些小软件,还有 win10 的 自带的视频制作功能,都不是很满意。 又不想下载那些专业的视频剪辑软件大材小用。 然后找到了 这个非常出名非常常用的多媒体编解码库,看了下文档试着用了下,它确
字符串→字节序列(Unicode) 编码解码 编码转换 散列/哈希 交换 执行 声明:本网站仅为软件开发者提供测试工具,请勿输入任何隐私信息,请勿用于其他用途! 由于其他用途所产生的一切后果本站概不负责,使用即代表你同意本声明! 本站开源地址:github,仅供学习交流。 首页 粤ICP备11054279号 ...
第一列是探针id或序列id,第二列是染色体,第三列是起始位置,第四列是终止位置。然后我们上传文件到coord2gene模块,结果如下 坐标转换基因名结果展示 可以看到我们的探针根据坐标信息已经比对到对应的基因了,同时还注释出了具体在exon还是intron等区域。关于注释文件,我们提供了refseq和gencode两个资源可选择,其实两个...