目前关于小鼠神经系统全脑以及特定脑区的发育过程的分析已经初见进展【1-6】,但是关于小鼠从原肠形成到出生的胚胎小鼠大脑的完整单细胞转录组图谱的建立仍然非常关键。为此,作者们对胚胎时期E7到E18每天的小鼠脑进行液滴基础的单细胞RNA测序(Droplet-based single-cell RNA sequencing)。 在移除低质量
在该专题的旗舰论文中,艾伦研究所(Allen Institute)的曾红葵博士等研究人员描述了首个完整小鼠大脑高分辨率转录组细胞类型图谱的创建方法以及主要发现。 研究团队结合了两个海量数据集——约700万个细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和约430万个细胞的空间转录组学(MERFISH)数据,将小鼠全脑细胞分为34个大类(class)...
仅仅两个月后,12月13日,美国加州大学圣地亚哥分校、Salk研究所、Allen研究所、哈佛大学、Broad研究所、加州大学伯克利分校联合发表了9篇Nature(另外还有1篇于9月27日发表,详见文中报道:Nature | 王潇团队绘制小鼠全脑高分辨率单细胞空间...
研究人员一共从成年小鼠大脑的117个解剖区域解析了超30万个甲基组细胞和17万个甲基组联合三维基因组细胞。通过迭代聚类和整合分析，联合了脑计划中的转录组数据集(10XRNA)以及基因组可及性数据集(snATAC-seq)，构建了一个基于甲基化的细胞分类图谱，包括4,673个细胞群组和274个多组学注释的亚类。▷图9：snmC-s...
据新华社报道，英国《自然》和《自然-方法》杂志4月9日发表的一组论文显示，科研人员通过描绘小鼠脑组织中1立方毫米内的细胞图谱，绘制出迄今最大、最详细的哺乳动物大脑连接图谱，包含20多万个细胞（其中有约8.2万个是神经元）、4公里长的轴突（延伸至其他细胞的分支）以及5.23亿个突触（细胞间的连接点）。这...
小鼠(Mus musculus)是使用最广泛的哺乳动物模式生物,因此是全面定义哺乳动物大脑组成和结构的自然首选。为了确定细胞类型的解剖背景,另一个关键要求是使用覆盖整个小鼠大脑的单细胞水平空间转录组学分析来表征每种细胞类型的精确空间位置。除了...
他们绘制出了迄今为止最详细的小鼠大脑图谱。这个图谱包含了1立方毫米脑组织中的8.2万个神经元。想象一下，这相当于一粒奇亚籽大小的区域里藏着如此复杂的结构！最令人兴奋的是，研究人员首次大规模记录了单个神经元的活动。他们让小鼠观看《黑客帝国》等视频，同时记录下7.5万个神经元的放电情况。图谱中包含了超过...
五、全脑图谱仍是＂科学珠峰＂现有成果仅覆盖小鼠大脑0.2%，要拼出完整脑图还需切割50万次。按当前进度，完整图谱可能要到2040年才能问世。但别灰心——我国团队正在攻关斑马鱼全脑图谱，这种1立方毫米的＂透明大脑＂或许能抢先揭开脊椎动物神经密码 。当我们在实验室里切割着比头发丝还细的脑组织时，是否也在切割...
1. 通过质谱流式细胞技术对发育中小鼠大脑细胞进行分类 作者首先从C57/BL6小鼠胚胎（E11.5至E12.5为全脑，E13.5及以后为分区域样本）和新生幼崽（P4）中收集脑组织。采用机械和酶促方法将组织分解成单细胞悬液，并使用顺铂作为非渗透性活力染料标记活细胞。使用Maxpar X8 Antibody Labeling Kits将每种抗体与...
这一创新性的图谱框架通过多模态成像技术的融合与数据对齐,展示了从胚胎期到成年期小鼠大脑各脑区的发育演变与神经纤维连接。每个发育阶段的图像不仅揭示了大脑的整体结构,还能清晰显示各个脑区的发育动态以及神经网络的形成过程,帮助研究者在同一三维空间内对不同发育时间点进行直观比较(图2)。