小分子则是生命体内重要的调节因子,它们能够通过与蛋白质的相互作用来调节蛋白质的结构和功能。本文将简要介绍蛋白质和小分子相互作用的几种基本形式,并重点讨论了目前研究中发现的一些重要调控机制。 一、蛋白质和小分子相互作用的基本形式 蛋白质和小分子之间的相互作用可以分为几种基本形式,其中最为常见的包括以下...
样品从芯片上电喷雾,产生高重复性完整的蛋白质-小分子复合物谱图【327】。这种自动化芯片阵列ESI源已广泛应用于多种筛选应用,特别是基于片段的药物发现,促进了非变性质谱对蛋白质-配体相互作用的自动化定量分析【195】。 ——另外,最近还开发了几种替代方法来促进非变性质谱测量的自动化。来自Genentech的科学家最近...
蛋白质和小分子相互作用的热力学(结合自由能ΔG bind和平衡解离常数K D)是表征一个药物小分子与其靶蛋白结合稳定性的重要依据,也是评价一个药物小分子与其靶蛋白亲和力大小的重要指标。而近些年来逐渐受到重视的蛋白质和小分子之间的结合动力学(解离速率常数k off和滞留时间)与药物小分子的药效和毒性等药代动力学...
毒性等药代动力学性质密切相关,所以在以靶蛋白和药物小分子的热力学性质为 依据进行药物设计时应同时考虑它们的结合动力学性质。基于蛋白质和小分子热 力学和动力学的计算方法和预测热力学和动力学的重要性,本论文的研究内容主 要有以下五个部分。 本论文第一章详述了蛋白质和小分子相互作用的重要性,从蛋白质和小...
摘要 本发明涉及一种处理小分子和蛋白质相互作用的计算方法,包括以下步骤:(1)读入蛋白质和小分子配体文件数据;(2)判断蛋白质和小分子配体中的原子类型;(3)随机初始化小分子配体的位置和角度;(4)运行SearchProtein算法,优化小分子配体的坐标和角度,Chemscore公式作为评价函数;(5)达到最大迭代次数后终止计算;(6)分...
发Alpha Screen技术已常规用于高通量筛选分析,以量化分析物的积累或耗竭、双分子相互作用和翻译后修饰。与Alpha Screens相关的高信噪比、动态范围和灵敏度,以及均匀的检测形式和试剂稳定性,使该技术特别适合高通量筛选应用。在这里,我们描述了Alpha Screen检测的发展,以使用高度小型化的1536孔形式鉴定酶和蛋白质-蛋白质...
本发明的方法可用于作为蛋白质效应物的小分子的高通量筛选。 因此,本发明涉及一种检测和/或表征蛋白质和小分子之间的相互作用的方法,所述方法包括以下步骤: a)提供结合有至少一个接头的固体表面,其中蛋白质、至少一种荧光染料和竞争化合物附接到至少一个接头,并且其中所述竞争化合物与蛋白质结合; b)在允许小分子...
最重要的生物大分子.蛋白质担负着各种生理功能,是生物性状的直接表达着.核酸是揭示生命遗传与变异的主要物质.因此,研究这些生物大分子与有机小分子,金属离子,特别是靶向药物小分子的作用机制,对于阐明生命的奥秘,促进人类的健康等方面都具有十分重要的意义,是当前生命科学,生物化学,药物化学及临床医学等领域的前沿和...
发明领域本发明涉及一种通过检测荧光染料发出的荧光的变化检测和/或表征蛋白质和小分子之间的相互作用的方法,并且涉及一种能用于所述方法的核酸结构。背景技术小分子能与蛋白质相互作用并影响其活性。因此,涉及病理学过程中,例如癌症发展中影响蛋白质活性的小分子的鉴定已获得广泛关注。为开发小分子蛋白质结合剂,有必要...
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