RNAseq原始数据中基因名称是"ENSG"开头的Ensemble ID,而实际分析时需要将ENSG转换为对应的基因名称。下面以GEO数据库 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213001) 下载到的GSE213001_Entrez-IDs-Lung-IPF-GRCh38-p12-logRPKMs-normalised.csv为例 (肺纤维化患者与健康人的Bulk tissue RN...
O.Sativa选用MSU或者RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，介绍一下MSU的ID，RAPDB的同理。The Rice ...
这个配置文件里面有esymbolid和基因id一一对应的关系,接下来我们需要一个脚本,就在上面图片里,然后将输入文件里面的esymbolid按照这个gtf配置文件里面的esymbolid和基因id一一对应的关系将esymbolid换成基因id,从而得到我们今天需要的这个矩阵,这个矩阵里面的基因名称和样本名称在发文章的时候,都是要用到的。这个矩阵里...
樱由罗我的最爱创建的收藏夹默认收藏夹内容:蛋白质名称转换为Gene symbol:简单快速将长长的蛋白质名称转换成基因名称,网络药理学蛋白质ID转换,转换率高,如果您对当前收藏夹内容感兴趣点击“收藏”可转入个人收藏夹方便浏览
脑缺氧.心缺血.急性胰腺炎.动脉粥样硬化等疾病都是由细胞坏死引起的.近日一项研究表明人体内存在的一种名为RIP3的蛋白激酶.能够将细胞凋亡转换成细胞坏死.通过调控这个酶的合成.就可以调控细胞的死亡方式.下列有关叙述错误的是A.从以上信息可知细胞坏死过程中存在基因的选
分析:人体造血干细胞来源受精卵的有丝分裂,故细胞内存在存在控制RIP3合成的基因,通过调节RIP3的蛋白激酶通过调节能量代谢,可以将肿瘤坏死因子诱导的细胞凋亡转换为细胞坏死,故抑制RIP3的活性可在一定程度上抑制细胞坏死. 解答:解:A、人体造血干细胞来源受精卵的有丝分裂,故细胞内存在存在控制RIP3合成的基因,A错误; ...
14.研究发现,人体内的一种名为RIP3的蛋白激酶,通过调节能量代谢,可以将肿瘤坏死因子诱导的细胞凋亡转换为细胞坏死.下列叙述正确的是( ) A.细胞膜和高尔基体参与该酶的加工和修饰 B.细胞坏死常会引起局部组织出现炎症反应 C.RIP3的活性由RIP3基因决定
这个配置文件里面有esymbolid和基因id一一对应的关系,接下来我们需要一个脚本,就在上面图片里,然后将输入文件里面的esymbolid按照这个gtf配置文件里面的esymbolid和基因id一一对应的关系将esymbolid换成基因id,从而得到我们今天需要的这个矩阵,这个矩阵里面的基因名称和样本名称在发文章的时候,都是要用到的。这个矩阵里...
RNAseq原始数据中基因名称是"ENSG"开头的Ensemble ID,而实际分析时需要将ENSG转换为对应的基因名称。下面以GEO数据库 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE213001) 下载到的GSE213001_Entrez-IDs-Lung-IPF-GRCh38-p12-logRPKMs-normalised.csv为例 (肺纤维化患者与健康人的Bulk tissue RN...