上图纵坐标:pathway名称;横坐标:富集因子。横坐标越大,基因产物在通路中富集显著性越可靠。 气泡大小:基因个数。气泡越大,基因个数越多 上图横坐标:Qvalue;纵坐标pathway名称 气泡大小:差异基因个数 上图横坐标:Ratio,该pathway下差异基因占差异基因总数的比例。 上图同时展示GO中细胞组分、分子功能、生物过程的...
3. 柱形图用三种不同颜色显示BP,MF和CC的富集分析结果 4. 气泡图+标签,显示BP,MF和CC的富集分析结果 这张图的横轴是富集倍数(fold enrichment),计算方法如下 fold enrichment = GeneRatio / BgRatio 上面四张图的横坐标分别为GeneRatio,Count,−log10(p.adjust)和Fold enrichment。 ☞完整的GO/KEGG富集分析...
参考资料: 1.完整GO和KEGG富集分析视频讲解 | 2.GO简介及GO富集结果解读 | 3.GO富集分析四种风格展示结果—柱形图,气泡图 | 4.KEGG富集分析—柱形图,气泡图,通路图 | 5.GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol | 6.GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算
名字,富集倍数(或者gene ratio),P值,基因count。 例如: 4维分析结果 做出来的例图如下 富集气泡图 该图包含的4维信息有: Y轴的通路名(pathway,结果表格的第一列) X轴的富集倍数(enrichment,结果表格的第二列) 点的颜色(P值,结果表格的第三列) 点的大小(count,该通路中包含的基因与输入基因列表交集的基因...
【“易”分钟系列】快速看懂结题报告分析图:GO富集分析条形图-欧易生物 上海欧易生物 7192 0 01:28 【“易”分钟系列】快速看懂结题报告分析图:KEGG富集气泡图-欧易生物 上海欧易生物 1.4万 0 00:55 【“易”分钟系列】快速看懂结题报告分析图:样本间相关系数热图-欧易生物 上海欧易生物 2994 0 ...
00:00/00:00 百奥益康 单细胞结果快速解读—GO富集分析气泡图 百奥益康发布于:北京市2022.08.12 16:23 分享到