宏蛋白组(Macromolecular crowding)是指细胞内外部环境中由于高浓度的蛋白质和其他大分子(如多糖、核酸等)存在而形成的拥挤状态。 一、主要特点和影响: 1、空间限制: 宏蛋白组导致的空间限制能够显著影响分子的折叠、聚集和相互作用。在拥挤的环境中,分子之间的有效浓度增加,从而加速了依赖浓度的过程,如蛋白质折叠、复...
宏蛋白组(Macromolecular proteomics)指的是对生物体内大分子蛋白质及其复合物的全面研究,特别是那些参与重要生物学功能和过程的大型蛋白质复合体。这一研究领域专注于识别、定量和理解宏大蛋白质及其组成的相互作用网络,如何通过这些相互作用执行其生物学功能,以及这些蛋白质如何参与细胞内的各种生命活动,包括信号传导、物质...
宏组学(Meta-Omics)是涵盖宏基因组学、宏转录组学和宏蛋白质组学的一门学科。其中宏基因组研究可以获知环境中微生物的物种组成,目前已经开展的如火如荼;宏蛋白组描述环境中微生物的蛋白表达,由于其研究的复杂性,目前还处于起步阶段,但蛋白水平的研究可以进行微生物群落的一致性、活性和功能分析,能够提供宏基因组无...
1、宏蛋白组背景 蛋白质是基因功能的直接体现者,在微生物宏基因组数据的基础上,进一步开展其相应的蛋白质组成及功能的研究,将能够深入发掘微生物群体中功能分子的丰度分布和功能取向。 2004年,Rodriguez-Valera第一次提出了“宏蛋白质组”的概念。一般而言,宏蛋白质组学通过质谱技术采集特定环境条件下微生物种群中全体...
宏基因组学+代谢组学数据:获得基因功能注释,解析代谢通路,从而揭示微生物功能基因对代谢的影响。 2、蛋白质功能与代谢通路分析 宏蛋白质组学+代谢组学,了解微生物产生的蛋白质在代谢反应中的作用,分析微生物如何通过其代谢产物和蛋白质与宿主相互作用。
深度宏蛋白质组学可以把微生物群落的基因信息和功能信息进行关联，揭示群体中发挥关键作用的微生物和与其相关的蛋白质功能，在“肠脑轴”、发病机制研究、疾病分型研究等多领域具有广泛的应用。技术路线 深度宏蛋白质组的主要步骤包括：微生物组样本总蛋白提取、肽段酶解、质谱采集、数据分析、生信分析和实验报告等。
宏蛋白质组研究环境中所有微生物蛋白质。蛋白质组主要针对单一生物体蛋白质。宏蛋白质组样本多取自土壤、海洋等复杂环境。蛋白质组样本常来自特定组织或细胞。宏蛋白质组技术需应对多样且复杂的蛋白质混合。蛋白质组技术相对更聚焦特定来源蛋白质分析。宏蛋白质组能发现新的功能蛋白和代谢途径。 蛋白质组利于深入了解...
一、宏蛋白组分析技术简介 宏蛋白组分析技术是一种全面研究生物体内蛋白质组的方法。在过去，科学家主要依赖于基因组学研究来了解生物体的基因信息。然而，蛋白质作为生物体内最基本的功能分子，扮演着调节生命过程的关键角色，它们的种类和功能对于生物体的正常运作至关重要。因此，宏蛋白组分析技术的出现填补了这方面...
目前宏蛋白组研究存在的难点有哪些？宏蛋白组学研究难点主要包括三个方面：样品制备、质谱检测、数据搜索。1、样品制备：①微生物组组成复杂，蛋白质提取需针对性优化 ②同一样品中的微生物组性质不同，需使用不同提取和裂解方案 ③外源性动物植物、人源蛋白、储存过程中其他来源的微生物污染 ④复杂样品提取蛋白的难度...