其主要含义是: 对特定环境中全部微生物的总DNA(也称宏基因组,metagenomic)进行克隆,并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据rDNA数据库设计引物,通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息。起源 宏基因组学这一概念最早是在1998年由威斯康辛大学植物病理学部门的Jo ...
病原宏基因组检测是指利用宏基因组学(metagenomics)的技术,从环境样品或临床样品中发现病原体的总基因...
病原宏基因组检测(Pathogen Macro Genome Testing,PMGT)是一种运用分子生物学技术,来检测人体内某种病原体携带的微生物基因组的方法。它是使用高通量测序或者其他类似的技术,通过对携带病原体的DNA和RNA序列进行测序来获得病原体基因组信息的方法。在该测试过程中,可以检测特定病原体的基因组特征,以及它们的毒性和可...
宏基因组学(metagenomics)是最近几年出现的微生物学的新学科分支,是环境微生物基因组研究的热点,对于分离污染物生物降解过程中有效的微生物及其产物十分重要。本研究将该法引入工业废水处理领域,希望分离到常规方法难以得到的新微生物克隆及其产物,并优化这些微生物或其产物的组合,为治理炼油、石化等工业废水寻找新...
宏基因组测序与分析是河北大学建设的虚拟仿真实验课程。课程简介 微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群,然而自然界中绝大多数的微生物不能通过传统方法进行纯培养,因而开展依赖于纯培养的生物技术识别微生物多样性难以得到全面的研究和利用,为了克服这一不足,研究者们发展了宏基因组学技术。本...
直接克隆天然产物的生合成基因簇并使其在可培养宿主中表达的宏基因组学技术,为发掘天然产物提供了一种新的方法。微生物I型聚酮化合物(PKIs)是由I型聚酮合酶(PKSIs)催化合成的一类微生物天然产物,具有良好的抗肿瘤、杀菌等多种生物活性。本课题拟利用宏基因组学方法直接从土壤中克隆环境微生物的PKSI生物合成...
2022年6月,三亚市人民医院|四川大学华西三亚医院与华大基因合作成立的病原宏基因组测序实验室和肿瘤精准检测实验室揭牌仪式举行。成立意义 海南首个地方医院“病原+肿瘤”二代测序基因检测实验室落地三亚,将为医院临床诊疗提供病原、肿瘤、遗传病等相关基因检测,为区域医疗临床检测、精准诊断提供更好的保障和依据。
宏基因组测序(mNGS)中检出序列数和相对丰度的意义分别是什么? 答: 检出序列数(reads)是真实测到的微生物的序列条数,是一个绝对值的指标,因此是检测到该微生物最直接的体现,更适合作为报告解读的主要指标。 相对丰度代表该微生物在...
国家标准《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》 由TC387(全国生化检测标准化技术委员会)归口 ,主管部门为国家标准化管理委员会。2021年5月21日,《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》由国家市场监督管理总局、中国国家标准化管理委员会发布,并于2021年12月1日实施。修订信息 2021年5月21日,《环境微...