在macOS和Linux上,可以直接在“应用程序”或“启动器”中找到“终端”。 输入conda安装命令: 在终端中输入以下命令来安装vcftools: bash conda install -c bioconda vcftools 这条命令会从bioconda这个conda频道中下载并安装vcftools及其所有依赖项。 执行安装命令: 按回车键执行上述命令。conda将开始下载并安装vcftoo...
make[1]:离开目录“/opt/vcftools/vcftools-vcftools-581c231” 4. 测试 键入vcftools 代码语言:javascript 复制 (base)[root@localhost vcftools-vcftools-581c231]# vcftoolsVCFtools(0.1.17)© Adam Auton and Anthony Marcketta2009Process Variant Call Format files For a listofoptions,please go to:https:...
把这两个路径加入PKG_CONFIG_PATH环境变量测试一下: 安装vcftools测试,果不其然,报错: 是否没有安装 zlib ? 使用yum 安装测试: 发现并不是这个原因。 继续百度查找,找到一个有效的方法,附上地址:https://www.cnblogs.com/pcat/p/5520317.html 开始下载解压安装zlib: wget http://www.zlib.net/zlib-1.2.11...
$ vcftoolsVCFtools(v0.1.13)©AdamAutonandAnthonyMarcketta2009ProcessVariantCallFormatfilesFora list of options,please go to:https://vcftools.github.io/examples.htmlQuestions,comments,andsuggestions should be emailed to:vcftools-help@lists.sourceforge.net 但是vcftools安装确实容易出现各种报错,所以建议用co...
1. 下载安装VCFtools 在官网(https://vcftools.github.io/index.html)下载VCFtools安装包,下载地址链接为https://vcftools.github.io/downloads.html,该网页内界面如下所示,方框内为下载按钮。如果点击的是View On GitHub需要进入release中寻找最新版本(https://github.com/vcftools/vcftools/releases/tag/v0.1.16)。
vcftools 快速安装日志 下载https://vcftools.github.io/examples.html tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/ cd vcftools/ 先执行./autogen.sh 报错autoreconf 找不到 ,执行yum install autoreconf...
这里,介绍第一篇:vcftools的安装。(当然,最简单的方法是conda安装,这里介绍一下源码编译安装) 1. 下载 https://vcftools.github.io/examples.html 下载到本地,上传到服务器中。 2. 解压缩 unzipvcftools-vcftools-v0.1.16-18-g581c231.zip cdvcftools-vcftools-581c231/ ...
1,编译安装 git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git cd vcftools bash ./autogen.sh ./configure make make install 1. 2. 3. 4. 5. 6. make 报错: g++ -DHAVE_CONFIG_H -I. -I../.. -g -O2 -MT vcftools-bcf_entry.o -MD -MP -MF .deps/vcftools-bcf_entry.Tpo -c -o ...
安装 在老版本不支持vcf4.2的情况下,可以选择安装新版vcftools。 下载地址为:https://sourceforge.net/projects/vcftools/files/ 以最新版本0.1.13版本为例,首先我们需要下载源码安装包: $ wget https://sourceforge.net/projects/vcftools/files/vcftools_0.1.13.tar.gz/download -o vcftools_0.1.13.tar.gz $ ...
1. 从官网上下载最新版本的VCFTools源码；2. 解压源码，并使用您的当前用户名登录系统；3. 进入源码文件夹；4.运行命令行：./configure；5.执行make操作，生成可执行文件；6.运行make install，VCFTools会被安装在/usr/local/bin文件夹；7.如果要将VCFTools移动到其他路径，那么运行make installprefix=[...