leave one out 孟德尔随机化解读 “Leave one out”和“孟德尔随机化”(Mendelian randomization)是两个不同的概念,但它们都与统计分析和遗传学有关。 1、Leave one out(留一法): 定义:留一法是一种交叉验证的方法,用于评估模型的泛化能力。在数据集有N个样本时,进行N次训练和验证,每次留下一个样本作为测试...
使用mr_leaveoneout_plot()函数可视化leave-one-out分析结果: res_loo <-mr_leaveoneout(dat) p3 <-mr_leaveoneout_plot(res_loo) p3[[1]] 指定要使用的测试,例如使用MR-Egger回归方法时,可以使用 mr_leaveoneout(dat, method = mr_egger_regression)。 ### 漏斗图 漏斗图中的不对称性有助于评估特定...
“leave-one-out”法指的是逐步剔除每个SNP,计算剩余SNP的meta效应,观察剔除每个SNP后结果是否发生变化,如果剔除了某一个SNP后,结果改变很大,说明存在某一个SNP对结果影响很大,这是我们不愿意看到的情况。 理想的情况应该是逐步剔除某个SNP后结果变化不大。 如下图所示,剔除每个SNP后,总体的误差线变化不大(所有的...
“leave-one-out”法指的是逐步剔除每个SNP,计算剩余SNP的meta效应,观察剔除每个SNP后结果是否发生变化,如果剔除了某一个SNP后,结果改变很大,说明存在某一个SNP对结果影响很大,这是我们不愿意看到的情况。 理想的情况应该是逐步剔除某个SNP后结果变化不大。 如下图所示,剔除每个SNP后,总体的误差线变化不大(所有的...
1)、评估结果是否稳健,结论是否靠谱; 2)、评估结果是否有潜在的偏倚(比如基因多效性,数据异质性);3)评估是否存在某一个工具变量严重影响结局变量; 敏感性分析主要用一下三个方法: 1)、基因多效性检验; 2)、异质性检验; 3)、“leave-one-out”法逐步剔除法,看每剔除一个SNP后,剩余SNP的效应值变化大不大。