harmonised_data <- mv_harmonise_data(exposure_dat = exposure_data,outcome_dat = outcome_data) 无法使用mv_harmonise_data函数是因为合并的SNP在每个暴露中均需要取se、beta、pval值,我的数据使用harmonise_data函数也是一样的效果,不知道是不是都一样。 无法使用mv_harmonise_data函数,可使用harmonise_data...
然后就到第二步和第三步,估计工具变量对暴露和结局的作用,这个时候要考虑工具变量一定不能直接影响结局(叫做pleiotropy),所以作者会用好几个算法来估计SNP的作用,并将多个SNP的效应合并,用到的是harmonise_data这个函数。工具变量其实有很多的,所以就有上面提到的pleiotropic问题,作者是用不同的方法来估计参数...
请问各位大佬,孟德尔随机化研究在harmonise的时候,总是出现以下报错“Error in check_required_columns(outcome_dat, "outcome") :The following required columns are missing from outcome: SNP, id.outcome, outcome, beta.outcome, se.outcome, effect_allele.outcome, other_allele.outcome”,但是检查了data里面这...