大家好,芬兰数据库(FinnGen)也是我们做孟德尔随机化研究必备的一个数据库,之我发了R8的下载整理方法,放在了VIP群。 目前芬兰数据库更新到R9了,前几天我发了下载方法,基本上可以一次性把所有的性状下载完毕:孟德尔随机化必备数据——芬兰数据库FinnGen R9数据下载。 这两天有空写了一下怎么把R9的数据整理成完美地...
网页获取 在网页中直接输入下边网址就开始了下载,这里下载的是卒中数据,更换表型只需要更换(C_STROKE)编号。编号可在具体信息中查询。按照前几次芬兰数据库数据分布存储情况,如果更新到R9只需将finngen-public-data-r8改成finngen-public-data-r9。 1 https://storage.googleapis.com/finngen-public-data-r8/summar...
大家好,芬兰数据库(FinnGen)也是我们做孟德尔随机化研究必备的一个数据库,之我发了R8以及R9的下载整理方法,放在了VIP群,链接在这里:孟德尔随机化必备——芬兰数据库FinnGen R9数据转化为暴露或结局 FinnGen R10的数据通过我给的文件即可下载,此文件来自官方,有以下列: 有能力的小伙伴可以自行探索,不想麻烦的,我已...
51,(1)双样本孟德尔分析,gwas为暴露(gwas.mrcieu.ac.uk/),EBI为(GCST开头的数据 )结局。MR分析 9020 1 2:03:52 App 【教程完】双数据库做药物靶点孟德尔,本地数据。乳腺癌为例。eqtl+gwas训练+芬兰验证+药物分子对接+共定位+ PheWAS+蛋白互作PPI+富集分析 1007 -- 39:14 App 21批量孟德尔随机化分析,...
孟德尔随机化芬兰数据库各个列名代表的意思:"#chrom" :染色体;"pos"位置;"ref"对照等位基因;"alt":效应等位基因;"rsids":变量标识符;"nearest_genes":最近基因; "pval" p值;"mlogp" -log10P;"beta":效应大小;sebeta效应大小标准差;"af_alt":效应等位基因频率;"af_alt_cases":病例中的效应等位基因频率...
芬兰数据库（FinnGen）是孟德尔随机化研究的重要资源。随着数据更新至R9版本，提供了一次性下载所有性状的途径。本文将指导您将R9数据整理为适合两样本孟德尔随机化（TwoSampleMR）分析的暴露或结局数据。整理方法遵循先前发布的指南，包括自动化程度提升，使得操作更为简便，所需调整步骤极少。同时，对于结果...
芬兰数据库，一个旨在深化疾病成因理解并推动相关治疗进步的大型研究项目，于2017年秋季启动。FinnGen研究依靠500,000名芬兰人的生物样本，结合遗传基因组数据与国家医疗记录，是全球少数具有此类规模的研究之一。研究的核心是利用芬兰全民基因研究的独特优势。对于GWAS数据，你可以通过r8.finngen.fi/进行详细...
大家看了我整个孟德尔随机化分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据,这样下来基本上一天就能精通孟德尔随机化的全流程分析,并能快速用公共数据库下载的孟德尔随机化数据在自己的电脑上跑完孟德尔随机化分析的全部流程。包括但不限于孟德尔随机化数据的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我...
快速获取方法是我根据芬兰数据库存储特点,自己改的下载链接,无需注册数据库信息,也不需要谷歌账号; 网页获取 在网页中直接输入下边网址就开始了下载,这里下载的是卒中数据,更换表型只需要更换(C_STROKE)编号。编号可在具体信息中查询。按照前几次芬兰数据库数据分布存储情况,如果更新到R9只需将finngen-public-data-r8...