2)打开SWISS-MODEL网站,创建一个新的project或者modeling (3)粘贴氨基酸序列;创建project名字;留下自己的邮箱;运作model。 一般耗时几分钟到半小时不等。运行成功后,所留下的邮箱会收到通知。 (4)得到一些model结果 GMQE :可信度范围为 0-1,值越大表明质量越好 QMEAN:区间-4-0,越接近0,评估待测蛋白与模板蛋白...
(1)找到目标基因的氨基酸序列,这一步在上一篇推送中介绍了。 (2)打开SWISS-MODEL网站,创建一个新的project或者modeling (3)粘贴氨基酸序列;创建project名字;留下自己的邮箱;运作model。 一般耗时几分钟到半小时不等。运行成功后,所留下的邮箱会收到通知。 (4)得到一些model结果 GMQE :可信度范围为 0-1,值越大...
SWISS-MODEL是一款用同源建模法预测蛋白质三级结构的全自动在线软件。SWISS-MODEL中一共有三个工作方式:First Approach mode:Alignment Interface mode:Project(Optimise)mode: 预测效果(使用范围) 如果目标序列与模板序列一致度极高,那么同源建模法是最准确的方法。 如果一致度能达到30%,那么模型的准确度就可以达到80%...
SWISS-MODEL是一款用同源建模法预测蛋白质三级结构的全自动在线软件。SWISS-MODEL中一共有三个工作方式:First Approach mode:Alignment Interface mode:Project(Optimise)mode:如果目标序列与模板序列一致度极高,那么同源建模法是最准确的方法。(1)找到目标基因的氨基酸序列,这一步在上一篇文章中介绍了。