3、导入蛋白序列,点击File菜单栏导入或者直接拖进MEGA7软件都可以 以上任一种形式都可以。 4、多序列比对,导入成功后如下图所示。 选择Alignment > Align by ClustalW > OK > 默认参数 比对后的结果如下图: 5、系统进化树构建,选择NJ法进行构建系统进化树 6、结果展示 第一种,步长树 第二种步长对齐树 其他...
将txt文件后缀改为fas.(这一步我一般会复制一个副本,以便后面建树要删除一些不可用的序列) 第二步:打开MEGA,本教程使用MEGA7.0版本,将刚才的fas格式文件拖拽到MEGA首页即可; 弹出以下窗口,点击Align; 弹出以下窗口,选中全部序列(Ctrl+A),序列颜色改变代表全部选中,点击肌肉(MUSCLE)的图标,也可以选旁边的W(Clustal ...
构建进化树需要两步,第一步在ncbi网站上搜集与你的目的基因同源性高的序列,下载下来。第二步是将数据导入mega软件,经过算法分析,软件会帮你构建出来进化树。你就可以把图片copy下来,放到你的论文里了。 构建系统发育树常见的方法有: 1、最大似然法(maximum parsimony method, ML) 最大似然法最准确,缺点是计算量...
第一步：搜集尽可能多的目标基因序列，包括核苷酸序列或氨基酸序列，理想的结果应包含15-20个物种，最初可以搜集30个序列作为备选。第二步：从数据库下载的FASTA格式的序列保存在一个txt文件中。第三步：将txt文件的后缀名改为fas。（建议复制一个副本，便于后续建树时删除不可用的序列。）第四步：在...
mega软件 比例尺 标尺 scale设置 空城风声 10:08 变色的坏坏 4:06:05 MEGA使用指导 Bioinfodiary 1.5万3 基因进化树的构建和美化(上)【NCBI基因序列的下载】 小卓爱磕盐 23:54 多序列比对与MEGA系统发育树 白云儿和白开水 11:56 如何用MEGA5对基因核酸序列进行比对处理 ...
随着生物技术的飞速发展，掌握生信工具的使用变得至关重要。本文将指导如何使用MEGA7构建进化树。首先，从MEGA7的下载地址开始，选择适合自己系统的版本。确保你的序列数据为fasta格式，如拟南芥SPL15基因的蛋白序列，选择同源序列高的前19条进行下载。导入蛋白序列时，可以从File菜单栏导入或直接拖入软件。接...
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 使用MEGA6.0构建的氨基酸序列的系统进化树如何分析 1 1/1 返回列表 查看: 6148 | 回复: 0 只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏 在APP中查看 【悬赏金币】回答本帖问题,作者bxs912112将赠送您 5 个金币 ...
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1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 图片 图片 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1 SPL15 [organism=Arabidopsis thaliana] [GeneID=...
1、下面以MEGA7为例来进行讲解,下面是下载地址,大家根据自己的系统进行下载即可。 http://www.megasoftware.net/ 2、序列的准备,必须是fasta结尾的格式,其他像txt格式,软件不能识别,以下以拟南芥SPL15基因的蛋白序列为例,进行同源序列查找 >NP_191351.1SPL15[organism=Arabidopsis thaliana][GeneID=824961]MELLMCSGQ...