4.从nr数据库中输出所有物种的蛋白质序列:nr.fa.gz blastdbcmd -db nr -dbtype prot -entry all -outfmt "%f" -out - | pigz -c > nr.fa.gz 5.根据accession号,从nr.fa.gz中提取特定物种的蛋白质序列(这一步我有试过直接从下载的nr数据库,输入acc.txt文件去提取,但是结果为空,不知道什么原因,数...
如需引用请正确使用奥。 有一点小小的问题给大家提醒一下,我在从gbk文件中提取蛋白质序列时,直接复制了网址中的对应内容,更改文件名之后运行,提示错误。是因为print "Dealing with GenBank record %s" % seq_record.id 这行没加括号。加完括号就成功啦。
prices = { 'ACME': 45.23, 'AAPL': 612.78, 'IBM': 205.55, 'HPQ': 37.20, '...
正如其他人所提到的，在尝试写入结果之前，您的代码将遍历整个输入。我想建议如何使用流媒体方法来实现这...
我将序列ID的后缀t1或者p1全部都去掉，使基因ID，转录本ID和蛋白质序列ID都一致，且没有后缀，然后就...
蛋白质通过运输通道蛋白提供的孔穿过外膜和内膜,其运动同样需要信号序列。靶蛋白质在穿过外膜和内膜时,必须解开其肽链,这个过程需要消耗ATP以提供能量。蛋白质运送到基质(线粒体内)需要跨内膜的电压,而蛋白质运送到叶绿体基质需要ATP水解。一旦进入基质,第一信号序列被信号序列肽酶除去。 基质中蛋白...
将等量的白菜梗和甘蓝梗提取液分别放入两个试管中,再分别加等量且适量的双缩脲试剂进行实验;若产生紫色反应,说明过氧化物酶的化学本质是蛋白质;显色反应强(紫色深)的一组,过氧化物酶含量高。 两种植物过氧化物酶的氨基酸序列不同(或空间结构不同,其他答案正确也可)。 [解析] (1)该...
②我们来看看这个结论是如何得出的。首先,科学家要分别提取人类和香蕉基因组中的基因序列并进行分析,根据分析结果可以预测出这些基因合成的全部蛋白质的氨基酸序列。然后,把人类和香蕉的基因所对应的蛋白质进行对比,相似度会各有不同,但是只要两个基因的相似度高于预期,就会被认为相似并记录下来。这项...