若想分析分子间相互作用,我们须全面地了解:分子间是否存在结合(相互作用),结合的快慢、结合的强弱,结合的机理、以及驱动力…… 所有这些关于分子间相互作用的研究常常采用生物物理的方法来进行,目前应用的一些技术都需要提前对作用的分子进行标记处理,但标记的处理常常会导致分子不是处于真正的原位环境,而且标记的处理会...
01 用OIM软件打开需要分析的数据，生成IPF图进行观察。02 从IPF图中可以看到数据中存在一些坏点，对数据...
由于反应物相同,因此TS-3S和TS-3R势垒的差异体现在这两个结构的能量差别上,差别最主要来自于SPA与Int-1分子的弱相互作用。为了说明这一点,文中用Multiwfn对这两个过渡态结构做了IGMH分析,给出了下图,对两个分子间存在的相互作用类型做了标注。其中N-H...O无疑是挺强的氢键,C-H...pi和C-H...O/F都...
在整块材料内部，每个小晶体（或称晶粒）整个由三维空间界面与它的近邻隔开。这种界面称晶粒间界，简称晶界。晶界厚度约为两三个原子。大多数天然晶体都是一个原子接一个原子或一个分子接一个分子来完成的但是JillianBanfield和同事们发现了一些晶体，它们是由含有成百上千个原子的“预制”纳米晶体装配而...
分子间的弱相互作用可以采用量子化学方法计算，如果所选基组不高，需要进行BSSE校正。
1)比如两个分子,分别称为分子A和分子B,两个分子之间会形成氢键作用 2)我用gaussian软件用B3LYP/6-311+G*基组分别计算了只有分子A存在的能量E(A)、只有分子B存在的能量E(B)以及同时存在两个分子(即分子A和分子B)的能量E(AB) 3)最后计算 认为E(AB)-E(A)-E(B)的绝对值是分子间的弱相互作用, ...
用Multiwfn做CDA分析就可以计算相互作用。对于价层轨道，CO和(Cu)n能级相差的不是特别悬殊。对于需要绘制...
RT.小弟跑完蛋白-小分子的动力学模拟之后，想分析一下小分子和蛋白之间的氢键、范德华力、静电作用等等...
如图所示,绝热隔板K把绝热的气缸分隔成体积相等的两部分,K与气缸壁的接触是光滑的.两部分中分别盛有相同质量、相同温度的同种气体a和b.气体分子之间相互作用势能可忽略.现通过电热丝对气体a加热一段时间后,a、b各自达到新的平衡状态. (1)试分析a、b两部分气体与初状态相比,体积、压强、温度、内能各如何变化?
前面讲”反离子释放产生的熵效应是复合物形成的关键“,后面讲”混合聚合物溶液的现有状态主要由不同大分子链之间相互作用的能量决定“,是否矛盾这两部分看似有些矛盾,但实际上它们描述的是不同层次的机制和相互作用,并且可以互相补充。下面详细分析为什么它们并不真正矛盾:1. 反离子释放的熵效应:局部热力学因素反离子...