1、打开生物医学之家,进入NCBI官网,找到人HDAC4基因各个转录本的序列并下载下来: 点击进入后,拖到下面,我们能看到该基因有5个转录本(这里要注意一下,我们可以看到NM开头和XM开头的。NM为转录产物序列,成熟mRNA转录本序列。XM为转录产物...
1.在NCBI网页上找到HDAC4基因,点击“RefSeqtranscripts”,查看所有转录本。(HDAC4默认homo sapapiens来源) 如果是小鼠的基因,只需在搜索的时候添加mouse字样即可 2、点击“send to”,选择“Gene Features”,然后“Create File”将多个转录本保存成文档。 3.将文档复制黏...
我其实需要找到这5个转录本的公共序列，然后根据这个公共序列设计引物就好了。但是由于我前面已经合成了。所以我就想看下，在我能够P出来的这些引物中有没有就是公共序列的引物。以可变剪接体A为例。1、打开Primer Premier软件，将可变剪接体A的CDS粘贴到框里。进行引物设计。2、Edit Primer 把自己合成的引物复制...
6. **获取引物在基因上的位置信息**：使用NCBI的在线工具，如GenBank或RefSeq，可以获得引物在基因上的位置信息，以便进一步分析引物的特异性。7. **分析多转录本情况**：如果存在多个转录本，需要针对每个转录本进行分析。比较不同转录本之间的序列差异，并评估引物在不同转录本上的特异性。8. **考虑引物的3'...
我其实需要找到这5个转录本的公共序列,然后根据这个公共序列设计引物就好了。但是由于我前面已经合成了。所以我就想看下,在我能够P出来的这些引物中有没有就是公共序列的引物。以可变剪接体A为例。 1、打开Primer Premier软件,将可变剪接体A的CDS粘贴到框里。进行引物设计。
那在讲解的过程种,我们说到qPCR引物设计就是要找个该基因所有转录本的共同区域,然后拿去设计引物。 那今天就给大家免费发送 “序列比对软件DNAMAN安装包” 如下即可下载: 长按识别二维码: 回复关键词:220326 下载下来之后打开: 打开后...
先下载第一个转录本的序列:点第一个转录本进入: 同理,把其他的四条也下载下来,最后如下: 2、打开生物医学之家,进入进CO序列比对官网: 进入官网后,我们选择DNA: 并且按照上面的例子将我们的5条序列都复制粘贴进去: 点击提交之后,需...