蛋白质与多肽之间的相互作用主要体现在蛋白质的合成和功能上。首先，在蛋白质的合成过程中，多肽链需要通过肽键连接氨基酸，并在肽聚酶的催化下逐步延长。此外，tRNA 和 rRNA 在蛋白质合成过程中也发挥着重要作用，tRNA 负责将氨基酸递送到多肽链上，而 rRNA 则组成核糖体，为多肽链的合成提供场所。其次，在蛋白质...
文章提出了一个可多层次预测多肽-蛋白相互作用的深度学习框架(CAMP)。该模型包括二元多肽-蛋白相互作用预测和相应的多肽结合残基鉴定，通过综合测试指标表明，CAMP可以成功地捕获多肽和蛋白质之间的二元相互作用，并识别参与相互作用的多肽上的结合残基。此外，CAMP在二元多肽-蛋白相互作用预测方面优于其他最先进的方法。模...
蛋白质与蛋白质的相互作用(PPI)在生物体内发挥着至关重要的作用,其中蛋白质与肽之间的相互作用占据了相当大的比例。据估计,蛋白质与肽的相互作用(PPI)在细胞内占比高达15-40%。这种相互作用在许多生物过程中都扮演着关键角色。🔍 蛋白质与多肽相互作用的意义: 无序蛋白区域:在真核细胞中,高达17%的蛋白是完全...
文章提出了一个可多层次预测多肽-蛋白相互作用的深度学习框架(CAMP)。该模型包括二元多肽-蛋白相互作用预测和相应的多肽结合残基鉴定,通过综合测试指标表明,CAMP可以成功地捕获多肽和蛋白质之间的二元相互作用,并识别参与相互作用的多肽上的结合残基。此外,CAMP在二元多肽-蛋白相互作用预测方面优于其他最先进的方法。模型...
多肽和蛋白质相互作用动力学探索-多肽和蛋白质相互作用动力学探索多肽和蛋白质是生物体内起着关键作用的分子,它们通过相互作用参与到许多生物学过程中。了解多肽和蛋白质的相互作用动力学对于揭示生物体的生理和病理过程具有重要意义。本文将探索多肽和蛋白质相互作用的动
多肽和蛋白质之间的相互作用研究一直是生物学和生物化学领域中的热门方向之一。在过去的几十年间,研究人员们利用各种分析方法逐步揭示了多肽和蛋白质之间的相互作用机制,为相关领域的发展做出了重大贡献。 一、多肽和蛋白质的相互作用机制 多肽和蛋白质之间的相互作用涉及到众多的分子间相互作用。其中,最为重要的是疏水...
关于伞形采样的概念在比较早的时候就已经提出了,在gromacs中就可以实现基本的伞形采样的功能(详见gromacs上的官网教程),可以通过编写自定义的mdp从而实现,此方法一般可以用于探究多肽或者配体与蛋白质本身的结合解离机制,对于窗口的数量的选择与合适的窗口选择对于模拟的准确性起到了至关重要的作用,对于伞形采样,早期的后...
蛋白质-多肽相互作用是细胞内生命活动的基础，调控着细胞的信号传导、基因表达、代谢调节等生物学过程。许多生物制药的研发与治疗策略都依赖于理解蛋白质-多肽相互作用的机制。因此，研究这些相互作用对于揭示疾病机理、发现新的药物靶点和开发生物制剂等方面至关重要。三、免疫沉淀接质谱技术在蛋白质-多肽相互作用研究中的...
文章提出了一个可多层次预测多肽-蛋白相互作用的深度学习框架(CAMP)。该模型包括二元多肽-蛋白相互作用预测和相应的多肽结合残基鉴定,通过综合测试指标表明,CAMP可以成功地捕获多肽和蛋白质之间的二元相互作用,并识别参与相互作用的多肽上的结合残基。此外,CAMP在二元多肽-蛋白相互作用预测方面优于其他最先进的方法。模型...
pepNN是近期发表在Communications Biology上的文章,作者提出提出了基于结构和序列的PepNN-Struct和PepNN-Seq方法,用于预测蛋白质上的肽结合位点。预测多肽-蛋白质相互作用的主要困难是肽的灵活性及其在结合时发生构象变化的趋势。基于此,作者开发了reciprocal attention,以同时更新...